2025年1月23日木曜日

細胞外マトリックスの包括調査

細胞外マトリックス(Extracellular Matrix, ECM)は、
コラーゲン(1)、酵素(2)、糖タンパク質(3)、ヒドロキシアパタイト(4)。
これら分解機序、装飾、鉱物(主に骨(5))を含め
細胞外高分子からなるネットワークを構築して、
周囲の細胞に構造的(6)、生化学的(7)、力学的(6)に支持します。
多細胞性は異なる多細胞系統で独立して進化したため(8)、
細胞外マトリックスの構成は多細胞構造間で異なりますが、
細胞接着(9)、細胞間コミュニケーション(10)、形態形成(253)
分化(11)、細胞分裂(12,13)、細胞の移動(245)、細胞死(251,252)。
これらは異なる細胞種、生物の比較的共通の機能として挙げられます。
進化の過程で脊索動物、脊柱動物、哺乳類とかけて、
特に機械的支持が重要な骨、腱、軟骨などを含めて(148)
細胞外マトリックスの組織、細胞腫特異的な進化、物質構成の中で
複雑性を伴いながら進化してきました(146-149)。

細胞外マトリックスは1922年に発見されました(144)。
細胞外マトリックスと呼ばれるようになったのは1965年です(145)


細胞外マトリックスに限定したプロテオーム解析を
Matrisomeと呼びますが、その包括解析の結果
構造因子では300種類、細かな構造変化を含めると700種類。
これらの遺伝子数が確認されています(157)。
但し、実際はそれを大きく超越するかもしれません(146)。
一つの理由として、選択的スプライングが
コラーゲン(164)、フィブロネクチン(162)、ラミニン(163)、エラスチン(165)。
これらで確認されているからです(161)。


細胞外マトリックスは細胞の特徴と合わせて3次元的に構築されます。
例えば、線維芽細胞では間質で線維性の接着を可能にします。
周りの弾性は細胞の分化に関わり、ヒアルロン酸は
多能性胚細胞の自己再生、分化を促進します(240)。
このような未分化細胞がどういった細胞系列に分化するかは
周辺の細胞外マトリックスの硬さに一定依存します(249)。
但し、硬さだけではなく神経系の幹細胞では
どちらかというと細胞外マトリックスの分解性。
それが維持のためにより重要でした(275)。

細胞分裂では2次元モデルでは硬いほうが起こりやすく(233,250)、
3次元モデルでは粘弾性ストレス緩和が速く、
細胞外マトリックスの分解性が高いと
細胞分裂、増殖が促進されるかもしれません(233)。

組織の形態形成では人工臓器の形成応用で調査されます(253)。
細胞外マトリックスと細胞の相互作用の中で
クロスリンカー、リガンド(255)、弾性(255,256)、水分(量)(258)
繊維性、空間的配置(257)、粘性(255,256)、空孔、分解性(254)。
これらが全て、組織形態形成に影響を与えるかもしれません(253)。


動物の細胞外マトリックスには、以下が含まれます。
- 間質マトリックス(Interstitial Matrix)(14)
- 基底膜(Basement Membrane)(15)

間質マトリックスは、血管-結合組織間など細胞間にある3Dタンパク質構造です。
水溶性の多糖類のゲル(17,18)と線維性タンパク質が間質空間を満たし、
細胞外マトリックス自身、細胞、組織全体にかかる
力学的(物理的)(16)、物質的(化学的)(19)ストレスに対する緩衝材として機能します。
また、線維芽細胞、間葉系細胞などにも作用すると考えられます。
間質を細胞が移動する際には、細胞外マトリックスの密度に応じて形を変えて
その形の変形、リガンドとの適度な結合を通じて(246)、
連続的に細胞を変形させながら移動していきます(245)。
細胞が高密度の周辺が硬い領域に向かって移動することをDurotaxisと呼びます(247)。
こうした細胞の移動は単一細胞でのみ起こるのではなく、
複数の細胞で相互作用しながら生じる可能性が指摘されています(247)。
こうした細胞の移動は間質液の水圧によっても影響を受けます(248)。
この時、より高密度のほうでは細胞形状が細く、突起様の形状となりますが、
こうした部分では細胞骨格、膜表面リガンドの密度が強くなり、
突起形成による力を生み出します(259)。それが移動の動力の一つとなります(260)。
より具体的にはフィロポディア形成に形成されるアクチンフィラメントの
逆行性輸送、焦点接着(インテグリン)、細胞外マトリックスによる力の生成です(233)。

腫瘍組織が主に結合組織に形成されると
下述するクロスリンカーの過形成を含めて、高次材料弾性特性として
一般的には細胞外マトリックスが硬くなると報告されています(263,264)。
硬い細胞外マトリックスは癌細胞の増殖、浸潤を促進します(265,266)。

基底膜は、結合組織の実質側に形成される土台となる層です(20)。
あるいは骨格筋や脂肪細胞の周りに形成されます(233,243)。
その厚さは数百nmから数μmです(233)。結合組織の1/10-1/1000の厚さです(244)。
各種結合組織には、異なるタイプの細胞外マトリックスが存在します。
例えば、骨組織は物質的強靭性を保証するために
コラーゲン線維と骨鉱物(ヒドロキシアパタイト)からなり、
細胞は体積比で数%と少なく、主に細胞外の物質で構成されます(21)。
他方で、
脂肪組織などの疎性結合組織は細網線維と基底膜からなります(22)。
腱などの密性結合組織は弾性材料を含む高密度の繊維からなります(22)。
脂肪組織、脳、乳房など柔組織では
典型的な弾性係数は数百Pa ~ 数kPa。
骨格筋など力のかかる組織では数十kPa、
軟骨、頭蓋骨では約100kPAとなります(233-235)。
細胞外マトリックスは多くの場合、
水を高次構造内に含み、移動性があるため粘弾性を持ちます(236)。
この粘弾性は一般的に変形速度を遅くします(236)。
より正確には高次構造の中に大きな空孔があるため、
多孔質弾性(poroelasticity)も考慮する必要があります(233,261)。
これは高次構造内部に水分子が豊富に存在することも関連します(233)。
このような永続的な変形が機械的ストレスを緩和させます。
例えば、脳の柔組織はやわらかく力学的ストレスが小さいです。
従って、構成される細胞外マトリックスは含水率の高い
主にヒアルロン酸など糖を含む物質が多いです(188)。
脳の含水率は80%で(238)、体全体の含水率は
骨などの少ない組織を含めると40%なので(239)、
脳は水分量の非常に多い組織です。
脳はより液体に近い挙動を示します(233:Fig.2)。
こうした機械的特性を運動、力に応じて変える働きもあります。
例えば、腱では小さい力では粘性挙動程度が高くなりますが、
運動時、力が強くなると力を効率的に伝えるため、
クロスリンカー依存の固体様の弾性特性が支配的になります(272)。

粘弾性のよる力の緩和、散逸は細胞サイクルの進行、分裂、分化。
これらに関与するかもしれません(233,273,274)。

基底膜はインテグリンと焦点接着を形成し、
インテグリンはアクセサリタンパク質を介して
細胞質側でアクチンなどの細胞骨格と連結します。
従って、細胞外マトリックスから細胞質、細胞核膜、核内は
こうした骨格となるたんぱく質で機械的に連結されているため、
機械的シグナル伝達に応じた組織調整が
細胞外マトリックス、インテグリン、細胞骨格
それぞれで生じる可能性があります(146,187)。
インテグリンは生物学的な機械的センサーの働きをします(237)。
また、機械的ストレスは材料そのものを力に応じて強く、硬くするような
永続的な変形を伴うことがあります(233.242)。
このような正のフィードバックループがあります。
これは細胞外マトリックスとして独立した材料だけではなく
細胞と細胞外マトリックスの連携の中でも生じます(262)。
材料の可塑的な変形は等方性から異方性へと材料指向特性を変更させます(268)。
但し、機械的ストレスがある閾値を超えると
材料、その複合体である組織は破壊されます(267)。
一方で、こうした可塑的な材料の変形は、
組織を決定的に破壊する力の閾値を増加させます。
例えば、動脈では強い血圧が生じたときには可塑的な変化、
すなわち、血管径を膨張させて、その力に適応するようになります(269)。
こうした可塑的な構造変化は水分などの粘性の他、より微視的には
クロスリンカーの移動、可塑性なども関連しているかもしれません(270)。
クロスリンカーは多くは非共有結合性で結合性が弱いとされています(233)。
従って、力に応じて結合状態が変化しやすいです(271)。

基底膜の硬さは上述したように悪性腫瘍と関連がありますが、
その他、細胞死、幹細胞分化、薬の感受性にも関連があります(236)。

基底膜で組織特異的にインテグリンと結合するラミニンは
結合組織である上皮細胞、内皮細胞(220)、
血管筋組織である平滑筋細胞(221)。
これらの分化を促し、成熟させる機能があります。
神経系の基底膜は状況が異なりますが、
テナスシンCは条件によっては
神経細胞を成熟させる可能性があります(222)。

基底膜の中でも拡張が必要な呼吸系の柔組織では
エラスチンの濃度が最も高く20-30%となります(223,224)。
肺胞の基底膜では発生初期には比較的高密度なラミニンで
基底膜が肺胞結合組織を固定しているように観察されますが、
エラスチンに関しては経年に伴い繊維構造が大きくなり、
それに応じて濃度も上がるように観察されます(226)。
喫煙、SARS、インフルエンザなど呼吸器系の炎症は
好中球濃度を上げて、エラスチン分解酵素エラスターゼを出すので(225)
エラスチン濃度が低下し、各肺胞の弾性が下がる可能性があります。
ただ、呼吸器感染症とエラスターゼ/エラスチン濃度変化。
これについては少なくとも研究は十分ではありません(227-229)。
肺炎とエラスチンの関係も2000年代に入って、
少なくとも活発には研究報告されていません(230-232)。


基底膜の細胞外マトリックスはプロテオーム解析で
組織特異的な組成、種類で
コラーゲン、糖たんぱく質、プロテオグリカン、ラミニン。
これらなどが含まれていることが確認されています(173)。
例えば、
以下の組織ではコラーゲンの発現パターンが異なります(213:Fig.2)。
心室組織(ventricular tissues)(214)
COL1A1 COL1A2 COL2A1 COL3A1 COL4A1 COL4A2 COL5A1 COL5A2 COL6A1 COL14A1 
大動脈弁(aortic valves)(215)
COL1A1 COL1A2 COL4A2 COL4A3 COL5A2 COL6A3 COL14A1 
上行大動脈(ascending aortas)(216)心臓拍出すぐの上方に向かう大動脈
COL1A1 COL1A2 COL4A1 COL4A2 COL5A1 COL6A1 COL6A3 COL12A1 COL14A1 COL18A3
伏在静脈(saphenous veins)(217)足の静脈
全てのコラーゲンが発現
※ただし、これらだけではない可能性があります。

上述したコラーゲンは血管組織では異なる機能を持ちます。
コラーゲンⅠ/Ⅳは平滑筋細胞の脱分化を促進/抑制します(213)。


細胞外マトリックスは架橋構造(クロスリンク)を通じて
繊維状の高次構造を同種、異種的に形成します。
このクロスリンクは高次構造を支持する重要な構造的要素ですが、
このクロスリンクが以下で過剰発現が見られます。
がん(175,178)、瘢痕(176)、線維症(177)、老化(180)、糖尿病(180)。
こうした構造は細胞外マトリックス構造を硬くします(179)。


植物の細胞外マトリックスには、
セルロースなどの細胞壁成分に加えて、複雑なシグナル分子が含まれます(23)。 
細菌などの単細胞生物は、菌膜を形成し、
細胞間で遺伝子(Horizontal gene transfer(25))を含めた物質の連携を行い
菌膜を構成する水性、粘性などの物質特性は細胞外マトリックスの一種である
細胞外高分子物質(Extracellular Polymeric Substances)で支持されています(24)。


細胞外マトリックスの構成要素は、
主に線維芽細胞など細胞内で生成されます(26)。
細胞内生産、エクソサイトーシスを経た分泌後、
それらは既存のマトリックスと凝集します(27)。
冒頭で述べた酵素は主にマトリックスプロテナーゼ(MMP)であり、
これは細胞外マトリックス分解酵素です。
分解と生成の元、一定の回転率で細胞外マトリックスは再構築されます(28)。
こうした分解と生成のバランスが崩れ、分解酵素が多くなると
がん(181)、(骨/リウマチ性)関節炎(182)、心臓血管疾患(186)、
慢性閉塞性肺疾患(183,184)、神経筋疾患(185)。
これら細胞外マトリックスと関連の深い組織で異常、疾患が生じます。
例えば、エラスチンを分解する分解酵素エラスターゼが
過剰に働き弾性を保証するエラスチンを分解すると
血管が硬化し、動脈硬化を引き起こすことがあります(218)。


細胞外マトリックスは線維性タンパク質に糖(グリコサミノグリカン)が
側鎖として装飾された状態、あるいは主にヒアルロン酸など
多糖からなる物質で複雑な3次元構造が構築されています。


<転写後装飾>
リシン残基のヒドロキシル化は
コラーゲンの一つの特徴的な転写後装飾です。
これがコラーゲン繊維形成、架橋形成、鉱物化。
これらに影響を与えることがわかっています(166)。
こうした鉱物化の影響は骨形成において重要ですが、
ヒドロキシル化の他、リン酸化も重要な役割を果たす。
このことが示されています(169)。
一方でユビキチン化は炭酸カルシウム蓄積の
負の制御因子であることが示されています(170)。
コラーゲンのアセチル化は例えば、
血小板の凝集を促進する効果があります(171)。
フィブロネクチンおいてもアセチル化は
糖誘導でのマトリックス高次構造形成を促進します(172)。
他方で、フィブロネクチンはヘパラン硫酸など
糖誘導で組織化されることが報告されています(174)。

臭素化(Bromination)もチロシン残基で生じます。
例えば、コラーゲンで確認されています(167)。
この臭素化はコラーゲンを含めた
基底膜、それに基づく組織の構築において
クロスリンクの形成促進を通じて
重要な役割を果たす可能性が示唆されています(168)。

シトルリン化(Citrullination)は病理を生じさせます。
例えば、リウマチ性関節炎ではコラーゲンがシトルリン化され
自己抗原として炎症の原因となります。
また、インテグリンとの結合性を低下させます(219)。


<<プロテオグリカン>>
グリコサミノグリカン(GAGs)は炭水化物ポリマーで、主に
細胞外マトリックスのタンパク質に結合してプロテオグリカンを形成します(29)。
プロテオグリカンは負の電荷を持ち(30)、正電荷ナトリウムイオンを引き付けます。
浸透圧を介して水分子を引き寄せ、間質、細胞周辺の水和状態に保ちます(31)。
また、プロテオグリカンは複合体化した細胞外マトリックス構造内で
成長因子を捕捉・貯蔵する役割を果たすこともあります(32)。

以下が細胞外マトリックス内に見られる主なプロテオグリカンです。

<ヘパラン硫酸>
ヘパラン硫酸(heparan sulfate)は、
全ての動物組織に存在する直線形構造の多糖です(33)。
細胞表面近傍で2つから3つのHS鎖が付加されたプロテオグリカンとして、
または細胞外マトリックスタンパク質として存在します。
細胞表面または細胞外マトリックスタンパク質に2~3本のHS鎖が近接して
あるいは側鎖として結合した状態で多種多様な他のタンパク質と結合し
成長過程(34)、血管新生(35)、血液凝固(36)、腫瘍転移(37)。
これら幅広い生物学的活動を調節します。

細胞外マトリックス、特に基底膜において、
ヘパラン硫酸が結合している細胞外マトリックスタンパク質は
ペルレカン(Perlecan)(38)、アグリン(Agrin)(39)、コラーゲン(Collagen)(40)。
これらが主要な材料として挙げられます。

<コンドロイチン硫酸>
コンドロイチン硫酸(chondroitin sulfate)は、生物に広くみられる
グリコサミノグリカン(ムコ多糖)の一種です。
長鎖の通常枝分れがみられない多糖です
2糖が反復する糖鎖に、硫酸が結合した構造を持ちます(42)。
通常、コアタンパク質と呼ばれる核となるタンパク質に共有結合した
プロテオグリカンとして存在します。
特に軟骨の細胞外マトリックスにアグリカンの側鎖として
アグリカン1つあたり、約100個という高密度で存在する
プロテオグリカンとして多く存在します(41)。
コンドロイチン硫酸は軟骨の他、
- 血管(43)、靭帯(44)、皮膚(45)、腱(46)
- 神経細胞体の軸索(47)
- 神経系の間質(48)
これらに一般的に存在します(2)。

<ケラタン硫酸>
ケラタン硫酸(Keratan sulfate)は、
他のグリコサミノグリカンと同様に、
繰り返し2糖単位を持つ直線状のポリマーです(49)。
特に角膜(50)、軟骨(51)、骨(52)に多く見られます。
ケラタン硫酸は、中央神経系でも合成され、
神経細胞の形成過程(Neural development)(54)や
神経損傷後のグリア瘢痕(glial scar)の形成(53)に関与しています。


<<非プロテオグリカン多糖>>
プロテオグリカン(タンパク質と結合した糖鎖)に属さない多糖類です。
すなわち、構造して側鎖ではなく比較的独立しています。
代表的には以下、ヒアルロン酸です。

<ヒアルロン酸>
ヒアルロン酸(Hyaluronic acidは高い分子量を誇る生体多糖です。
ほとんどの結合性を持つ組織、上皮組織、内皮組織などに観られます(55)。
内皮組織では内皮細胞への血流のシェアストレス調整機能があります(56)。
間質を埋めるゲル成分の主要な骨格材料です(57)。
また、体液の中でも滑液、硝子体液、臍帯血などに多く見られます。
ヒアルロン酸が持つ保水力(重量比1000倍水分量(58))により
眼の硝子体(59)、関節(軟骨(60))など液性の強い結合組織において
特に重要な役割を果たします。
ヒアルロン酸は、
細胞の離脱(61)、胚発生(62)、細胞分裂(有糸分裂)(63)、
細胞の移動(64)、腫瘍組織発達(65)、転移(66)、炎症(67)。
これら多様な生物学的機能に関わります。
その基本的な構造は繰り返し単位である
D-グルクロン酸とN-アセチルグルコサミンから成り立っています。


<<たんぱく質成分>>

<コラーゲン>
コーラゲン(Collagen)はヒトの体の中で最も豊富に含まれるたんぱく質です。
身体のたんぱく質の25-35%を占めます(69)。
44種類のコード遺伝子が確認され、
28種類の異なるたんぱく質構造があります(146,158)。
コラーゲンは結合組織(70,71)、皮膚(72)、骨(73)、腱(74)、軟骨(75)。
これら組織などに多く含まれます。
コラーゲンは3本の鎖から成る
3重らせん構造(トリプルヘリックス)構造を持ちます(76)。
ベースはα鎖であり、分子構造が異なる
2種類のα1、α2の鎖を母体としています。
これらの鎖の本数の組み合わせでタイプに分かれます。
この3重らせん構造が機械的な強靭性を保証します。
その弾性(ヤング率)は300MPa~1.2GPaにもなります(241)。
また材料として安定性が高く(77)、特別な分解条件でなければ、
体内での保持時間も長いです。
例えば、腱であれば、タイプⅠは197年の半減期です(78)。
コラーゲンは線維性のタイプⅠ型が一番豊富に存在します。
コラーゲンの主な機能は
- 基底膜の完全性(90)
- 結合組織、骨、腱、皮膚などの構造的支持(79)
- (骨などの)組織の再生、修復(80)
- 血管の形成、構造的支持(81)
- 細胞接着(82)
- 細胞の移動(84)、上皮間葉転換(83)、転移(85)
- 細胞の分化(86)
- サイトカインの持続的放出(保持)(87)
- 機械的シグナル伝達(88)
- 抗がん効果(89)

コラーゲンは、形成する構造に応じて以下のように分類されます(68)。
1- 線維性(タイプI, II, III, V, XI)
2- 非線維性
- FACIT(タイプIX, XII, XIV)Fibril-Associated Collagens with Interrupted Triple Helices
- 短鎖(タイプVIII, X)
- 基底膜(タイプIV)
- Multiplex in(タイプXV, XVIII) Multiple Triple Helix domains with Interruptions 
- MACIT(タイプXIII,XVII)Membrane-Associated Collagens with Interrupted Triple Helices. 
- その他(タイプVI, VII)

<エラスチン>
エラスチン(Elastin)は高い伸縮性(フック弾性)を持つたんぱく質です。
高度な折りたたみ-直線状構造変化をエントロピー誘導で駆動できるため、
細胞外の材料として生体の弾性を支える重要なたんぱく質です(91,92)。
エントロピーが高い安定な状態では折りたたまれており、
その高次3次元構造により物質として非常に安定です。
成人になると線維芽細胞からの分泌が低下し(94)、
そこから徐々に失われていきますが、寿命が非常に長いため
その喪失スピードは非常にゆっくりです。
但し、分泌量の変化は組織によって異なるかもしれません。
半減期は健康な状態で70年以上といわれてます(93)。
エラスチンの確認されている機能は以下です。
- 血管生成(95)
- 細胞接着(96)
- 血管平滑筋細胞の弾性支援(97)
- 免疫細胞の走化性(誘導)(98)
- 肺の拡張機能(99,100)
- 心臓(心室)の(拡張)機能の安定化(101)
- 骨格筋の機能(運動中など)(102)
従って、筋組織、呼吸器など運動性の高い組織において
細胞外の支持構造として重要なたんぱく質です。

トロポエラスチンとして主に線維芽細胞から放出されます。
可溶性の単量体でエラスターゼや他の酵素によって架橋結合し、
不可溶性の弾性繊維としてエラスチンとして成熟します。

<フィブロネクチン>
フィブロネクチンは遍在する細胞外マトリックスです。
脊柱動物の発現される高分子量の糖タンパク質です。
分子量は470-500kDaで(107)、一次構造の長さは120-160nmです(108)。
この1次構造を基本単位として下記高次構造が形成されます。
二次構造(αヘリックスやβシート)(109)
三次構造(ポリペプチドの全体的な三次元形状)(110)
四次構造(二量体形成)(111) 

フィブロネクチンのサブタイプは以下があります。
- 血漿フィブロネクチン(plasma fibronectin、pFN)
- 細胞性フィブロネクチン(cellular fibronectin、cFN)
- 胎児性フィブロネクチン(fetal fibronectin、fFN)
これらは細胞膜上にある細胞接着分子である
インテグリン(112)やコラーゲン(113)と結合性を持ちます。

血漿フィブロネクチンは肝細胞から分泌されます(114)。
細胞表面に結合する前にはコンパクトな3次元構造を取り、
血液中を流動し、血栓成長を促します(115)。
コンパクトな構造では特に構造の大部分を占める
15単位直列に結合したタイプⅢフィブロネクチンが
直線ではなく、3次元的に折りたたまれた構造をとります(116)。
静電引力(117)、疎水性相互作用(118)、
水素結合(118)、二硫化結合(116:Fig.1)
これらなどがコンパクトな3次元構造と関連します。
他方で
細胞性フィブロネクチンは主に線維芽細胞から放出されます。
血漿フィブロネクチンは可溶性が高く、血流に分布する一方で、
細胞性フィブロネクチンは組織常在性が高く、
細胞外マトリックスに高い結合性を持って取り込まれることがあります。
細胞性フィブロネクチンは選択的スプライシングを取り、
時間依存的(120)、細胞種特異的(119)に異なるアイソフォームを発現します。
細胞フィブロネクチンの機能は他の細胞外マトリックスと類似します。
すなわち、以下です。
- 細胞接着(121)、増殖(122)、移動(121)
- 細胞外マトリックスの蓄積(123)
- 成長因子の制御(124)
コーラゲン、フィブリリン、フィブリン、ラミニン、テナシン。
これらなど多様な細胞外マトリックスを結合性を持つのが特徴です。

<ラミニン>
ラミニン(Laminin)はほとんどの動物の組織にある
結合組織の基底膜構成物質の一つで、細胞とも結合します(125)。
側鎖として多糖構造を持つ糖たんぱく質です。
ラミニンはα、β、γからなる異種3量体からなり(126)、
生体内で自己組織化することができます(127)。
これらの組み合わせにより少なくとも16種類の
機能的なαβγ3量体があります(146)。
結合する細胞接着分子は基底と結合性を持つ
インテグリン(128)、ジストログリカン(複合体構造)(129)などです。
ラミニンは多くのサブタイプがあり
それぞれにおいて特異的なインテグリンサブタイプと結合します(130)。
その理由はα鎖にある特定のLGドメインが
特定のインテグリンと結合し、γ1鎖のテールと近接して配置されることで、
複数の接触点を作り出し、インテグリンとの結合が強化されるからです(159)。
このような特異的インテグリン結合性は
細胞種、組織特異的な特性、遺伝子発現を示し(131,160)、
基底膜の細胞外マトリックスの細胞種、結合組織特異的特性。
これを支持する重要な接点かもしれません。
結合組織の基底膜としての支持機能のほか以下の機能を持ちます。
- 胚形成(132)
- 神経形成(133)

<フィブリリン>
フィブリリンは糖たんぱく質からなる細胞外マトリックスで
そのマイクロ繊維構造は
上皮細胞組織、内皮細胞組織、筋組織(骨格筋、平滑筋、腱)など
結合組織を機械的に支持、保護する働きがあります(150)。
細胞間の接合に関わるカドヘリンなどの接着結合、
オクルーディン、クローディンなどの密着結合などの細胞接着分子も
同様に結合組織を細胞間で支える細胞接着分子です(151)。
細胞外マトリックスではエラスチンの形成と関連があります(152)。

フィブリリンは主に2つの主要なサブタイプがあります。
フィブリリン-1(Fibrillin-1)は
最も広く分布しているサブタイプで、
エラスチン繊維の形成に重要な役割を果たします。
主に皮膚(153)、血管(154)、肺(155)、筋組織(155)などで見られます。
主に大人の組織で多く見られます。
一方で、
フィブリリン-2(Fibrillin-2)は
主に胎児の発育段階で発現しています(156)。
フィブリリン-2は胎児のエラスチン繊維の形成に関与しています。

<テナスシン>
テナスシンは脊柱動物の胚発生時に豊富に含まれる
細胞外マトリックスです(134)。
テナスシンのサブタイプは以下です。
Tenascin-C、Tenascin-R、Tenascin-X、Tenascin-W

テナスシンCは選択的スプライシングにより多様な構造を取ります。
これは細胞内のpHによって制御されています。
例えば、通常の細胞よりも酸性度の高いpH7.30–7.50の
胎児細胞や増殖性の高い癌細胞は
長くて、分子量の大きなテナスシンCを発現する傾向にあります(135)。
神経系(140)、血管内皮細胞(141)、筋細胞(142)、骨芽細胞(143)。
これらなどで発現が見られます

テナスシンRは神経系に特異的に発現され、
乏突起膠細胞や小さな神経細胞に作用します(136)。
2つの異なる大きさ持つサブタイプがあります。
TN-R 160 (160kDa) TN-R 180 (180kDa)です。
Alison Woodworth(敬称略)らがFig.1Dに示すように(136:Fig.1D)
あらゆるドメインに複数の糖鎖が側鎖として存在できます。
これらの糖鎖は通常、分子質量比で10-20%を占めます。
テナスシンCでは6量体、テナスシンXでは3量体でしたが、
テナスシンRでは2量体、3量体構造を取ります(34:Fig.1E)

テナスシンXは全体で450kDaの糖たんぱく質です。
心臓と骨格筋で多く発現が見られます(138)
下述するように5つの特徴的なドメインをもちます(137)。
テナスシンCでは6量体ですが、
テナスシンXは3量体です(137:Figure 1)。

テナスシンWは約180kDa(139)の糖たんぱく質です
口蓋形成、骨形成、平滑筋形成。
これらの際に発現が見られます(139)。


細胞外マトリックスは3次元の物質相互作用のある糖たんぱく質なので
細胞から放出された核酸(DNA、RNA)、細胞外小胞を
少なくとも一時的に結合して構造内に保持する働きががあります(103)。
このような効果を生物学的な足場としてECM bioscaffoldsと呼びます(104)。
免疫機能の調整にこれらの物質が関与している可能性があります(105,106)。


Perineuronal netsは神経細胞の周りに張り巡らされた
主にコンドロイチン硫酸、ヒアルロン酸、テナスシンR
これらなど糖鎖、多糖、たんぱく質を含む(190)
細胞外マトリックスの網状構造体です(188)。
特に介在抑制系神経細胞、脊髄の運動神経細胞(189)。
これらの周辺に多いとされています(188)。
これは発火スピードが速いGABA作動性介在ニューロンと
Perineuronal netsが関連があるからです(191)。
運動と関連する神経細胞の保持に重要なため、
自発的な運動は関連神経でPerineuronal netsの発現を高める。
この可能性が示唆されています(200)。
脊髄損傷後のリハビリテーションでも
このネット構造の上昇が確認されています(201)。

また、Perineuronal netsは神経細胞の形を固定するため
2歳までの脳の発達期において、特に
抑制系神経細胞の発達の終了との関連可能性があります(192,193)。
従って、神経細胞の軸索が変化している可塑的な時期には
このネット構造が分解されます(197)。

Perineuronal netsは主に髄鞘の間のイオンチャンネルが形成される
軸索のランヴィエ絞輪(nodes of Ranvier)に集中します(188)。
従って、軸索のイオン電導に関わっている可能性があります(188,194)。

Perineuronal netsは、神経細胞の成熟(204)
シナプス(形成/可塑性)、長期増強(202,203)、記憶(198)、行動。
これらなど神経系の基本的な機能に関連します(195)
軸索の周りに主に構築され神経伝達部の重要な構造的機能なので
神経伝達性の異常である以下の精神疾患にも関連します(196)。
統合失調症(209)、双極性障害(210)。
以下の、ストレス、毒性に対する神経保護効果があります。
酸化ストレス(205)、興奮毒性(206)、アミロイドβ毒性(206)。
従って、以下、神経変性疾患とも関連があります。
アルツハイマー病(207)、筋萎縮性側索硬化症(208)。
特に酸化ストレスに高速発火のPV+抑制系神経細胞は弱いので(188)、
Perineuronal netsによって保護することが重要です。
特にアグレカン、テナスシンRなど
タンパク質成分が鉄などの酸化ストレスから
神経細胞を保護する上で重要な役割がある可能性があります(212)。
このPV+介在ニューロンはNREM睡眠の長さを上げるので(211)、
PNN形成に異常がある精神疾患罹患で睡眠の質が低下することに
少なくとも間接的に関連するかもしれません。

Perineuronal netsは一般的な細胞外マトリックスが有するように
ECM bioscaffoldを形成する可能性があります。
具体的には以下の成長因子、細胞接着分子が
構造内に誘導される可能性があります(188)。

(成長因子(Growth Factors))
- ミッドカイン(midkine)(199)
- プレオトロフィン(pleiotrophin, PTN; also known as HB-GAM)(199)
- 神経成長因子(nerve growth factor, NGF)
- 脳由来神経栄養因子(brain-derived neurotrophic factor, BDNF)(199)
- ニューロトロフィン3(neurotrophin 3, NT3)
- 肝細胞成長因子 (hepatocyte growth factor, HGF)
- 線維芽細胞成長因子2 (fibroblast growth factor 2, FGF2)

(細胞接着分子(Cell Adhesion Molecules))
神経細胞接着分子 (neural cell adhesion molecule, NCAM)
神経-グリア細胞接着分子 (neuron-glia cell adhesion molecule, NG-CAM)



(参考文献)
(1)
Ramachandregowda Sowbhagya a, Harsha Muktha a, Thippenahalli Narasimhaiah Ramakrishnaiah a, Adagur Sudarshan Surendra b, Subhas Madinoor Sushma a, Chandrashekar Tejaswini a, Karunakaran Roopini a, Somashekara Rajashekara
Collagen as the extracellular matrix biomaterials in the arena of medical sciences
Tissue and Cell Volume 90, October 2024, 102497
(2)
Meagan McMahon 1, Siying Ye 1, Jess Pedrina 1, Daniel Dlugolenski 1, John Stambas
Extracellular Matrix Enzymes and Immune Cell Biology
Front Mol Biosci. 2021 Aug 30:8:703868
(3)
A M Hocking 1, T Shinomura, D J McQuillan
Leucine-rich repeat glycoproteins of the extracellular matrix
Matrix Biol. 1998 Apr;17(1):1-19. 
(4)
M. I. KAY, R. A. YOUNG & A. S. POSNER 
Crystal Structure of Hydroxyapatite
Nature volume 204, pages1050–1052 (1964)
(5)
Xiao Lin 1, Suryaji Patil 1, Yong-Guang Gao 1, Airong Qian 1
The Bone Extracellular Matrix in Bone Formation and Regeneration
Front Pharmacol. 2020 May 26:11:757.
(6)
BRYAN N BROWN 1, STEPHEN F BADYLAK 1
Extracellular matrix as an inductive scaffold for functional tissue reconstruction
Transl Res. 2013 Nov 8;163(4):268–285.
(7)
Beatrice Yue 
Biology of the Extracellular Matrix: An Overview
J Glaucoma. 2014 Oct-Nov:S20–S23.
(8)
Suat Özbek *, Prakash G Balasubramanian *, Ruth Chiquet-Ehrismann †, Richard P Tucker ‡, Josephine C Adams §,
The Evolution of Extracellular Matrix
Mol Biol Cell. 2010 Dec 15;21(24):4300–4305. 
(9)
Iain A Drummon
Polycystins, focal adhesions and extracellular matrix interactions
Biochim Biophys Acta. 2011 Oct;1812(10):1322-6
(10)
Iñigo Valiente-Alandi 1, Allison E Schafer 1, Burns C Blaxall 1
Extracellular matrix-mediated cellular communication in the heart
J Mol Cell Cardiol. 2016 Jan 14;91:228–237.
(11)
C Streuli 1
Extracellular matrix remodelling and cellular differentiation
Curr Opin Cell Biol. 1999 Oct;11(5):634-40.
(12)
Manuel Théry 1, Victor Racine, Anne Pépin, Matthieu Piel, Yong Chen, Jean-Baptiste Sibarita, Michel Bornens
The extracellular matrix guides the orientation of the cell division axis
Nat Cell Biol. 2005 Oct;7(10):947-53.
(13)
Lijuan He 1,2, Weitong Chen 1, Pei-Hsun Wu 1,2, Angela Jimenez 1,2, Bin Sheng Wong 1,2, Angela San 1, Konstantinos Konstantopoulos 1,2,3, Denis Wirtz 1,2
Local 3D matrix confinement determines division axis through cell shape
Oncotarget. 2015 Oct 15;7(6):6994–7011.
(14)
Dong Fan 1, Esther E Creemers, Zamaneh Kassiri
Matrix as an interstitial transport system
Circ Res. 2014 Feb 28;114(5):889-902.
(15)
Bryan Brown 1, Kristina Lindberg, Janet Reing, Donna Beer Stolz, Stephen F Badylak
The basement membrane component of biologic scaffolds derived from extracellular matrix
Tissue Eng. 2006 Mar;12(3):519-26.
(16)
M Chiquet 1
Regulation of extracellular matrix gene expression by mechanical stress
Matrix Biol. 1999 Oct;18(5):417-26. 
(17)
Aleksandra Kuzan 1, Agnieszka Chwiłkowska, Magdalena Kobielarz, Celina Pezowicz, Andrzej Gamian
Glycation of extracellular matrix proteins and its role in atherosclerosis
Postepy Hig Med Dosw (Online). 2012 Oct 29:66:804-9.
(18)
K L Goa 1, P Benfield
Hyaluronic acid. A review of its pharmacology and use as a surgical aid in ophthalmology, and its therapeutic potential in joint disease and wound healing
Drugs. 1994 Mar;47(3):536-66. 
(19)
Eric S White
Lung Extracellular Matrix and Fibroblast Function
Ann Am Thorac Soc. 2015 Mar;12(Suppl 1):S30–S33
(20)
Peter D Yurchenco 1
Basement membranes: cell scaffoldings and signaling platforms
Cold Spring Harb Perspect Biol. 2011 Feb 1;3(2):a004911
(21)
Xiao Lin 1, Suryaji Patil 1, Yong-Guang Gao 1, Airong Qian 1
The Bone Extracellular Matrix in Bone Formation and Regeneration
Front Pharmacol. 2020 May 26:11:757. 
(22)
Payvand Kamrani; Geoffrey Marston; Tafline C. Arbor; Arif Jan.
Anatomy, Connective Tissue
StatPearls [Internet].
(23)
Colin Brownlee 
Role of the extracellular matrix in cell-cell signalling: paracrine paradigms
Curr Opin Plant Biol. 2002 Oct;5(5):396-401. 
(24)
Thomas Seviour et al.
Extracellular polymeric substances of biofilms: Suffering from an identity crisis
Water Research Volume 151, 15 March 2019, Pages 1-7
(25)
Claudia Michaelis 1, Elisabeth Grohmann 1
Horizontal Gene Transfer of Antibiotic Resistance Genes in Biofilms
Antibiotics (Basel). 2023 Feb 4;12(2):328
(26)
Kristine Y. DeLeon-Pennell a, Thomas H. Barker b, Merry L. Lindsey 
Fibroblasts: The arbiters of extracellular matrix remodeling
Matrix Biology Volumes 91–92, September 2020, Pages 1-7
(27)
Yue Gao 1, Shuyun Liu 1, Jingxiang Huang 1, Weimin Guo 1, Jifeng Chen 1, Li Zhang 1, Bin Zhao 1, Jiang Peng 1, Aiyuan Wang 1, Yu Wang 1, Wenjing Xu 1, Shibi Lu 1, Mei Yuan 1, Quanyi Guo 1
The ECM-Cell Interaction of Cartilage Extracellular Matrix on Chondrocytes
Biomed Res Int. 2014 May 18;2014:648459.
(28)
M P Jacob 1, C Badier-Commander, V Fontaine, Y Benazzoug, L Feldman, J B Michel
Extracellular matrix remodeling in the vascular wall
Pathol Biol (Paris). 2001 May;49(4):326-32.
(29)
J E Scott
Supramolecular organization of extracellular matrix glycosaminoglycans, in vitro and in the tissues
FASEB J. 1992 Jun;6(9):2639-45
(30)
Jarett Casale; Jonathan S. Crane.
Biochemistry, Glycosaminoglycans
StatPearls [Internet].
(31)
M B Sweet, E J Thonar, A R Immelman
Regional distribution of water and glycosaminoglycan in immature articular cartilage
Biochim Biophys Acta. 1977 Nov 7;500(1):173-86. 
(32)
Z. Söderlund, A. Ibáñez-Fonseca, S. Hajizadeh, J. C. Rodríguez-Cabello, J. Liu, L. Ye, E. Tykesson, L. Elowsson & G. Westergren-Thorsson 
Controlled release of growth factors using synthetic glycosaminoglycans in a modular macroporous scaffold for tissue regeneration
Communications Biology volume 5, Article number: 1349 (2022) 
(33)
Dallas L. Rabenstein
Heparin and heparan sulfate: structure and function
Nat. Prod. Rep., 2002, 19, 312–331
(34)
N Perrimon 1, M Bernfield
Specificities of heparan sulphate proteoglycans in developmental processes
Nature. 2000 Apr 13;404(6779):725-8.
(35)
Mark M Fuster ☼,†,1, Lianchun Wang
Endothelial Heparan Sulfate in Angiogenesis
Prog Mol Biol Transl Sci. 2010;93:179–212.
(36)
Jian Liu 1,*, Lars C Pedersen 
Anticoagulant Heparan Sulfate: Structural Specificity and Biosynthesis
Appl Microbiol Biotechnol. 2006 Nov 28;74(2):263–272
(37)
R D Sanderson
Heparan sulfate proteoglycans in invasion and metastasis
Semin Cell Dev Biol. 2001 Apr;12(2):89-98
(38)
Mary C Farach-Carson 1, Curtis R Warren 2, Daniel A Harrington 2, Daniel D Carson 
Border patrol: insights into the unique role of perlecan/heparan sulfate proteoglycan 2 at cell and tissue borders
Matrix Biol. 2014 Feb:34:64-79
(39)
G Tsen 1, W Halfter, S Kröger, G J Cole
Agrin is a heparan sulfate proteoglycan
J Biol Chem. 1995 Feb 17;270(7):3392-9. 
(40)
R G LeBaron 1, A Höök, J D Esko, S Gay, M Höök
Binding of heparan sulfate to type V collagen. A mechanism of cell-substrate adhesion
J Biol Chem. 1989 May 15;264(14):7950-6.
(41)
H Watanabe 1, Y Yamada, K Kimata
Roles of aggrecan, a large chondroitin sulfate proteoglycan, in cartilage structure and function
J Biochem. 1998 Oct;124(4):687-93
(42)
Fotini N. Lamari, Nikos K. Karamanos
Structure of Chondroitin Sulfate
Advances in Pharmacology Volume 53, 2006, Pages 33-48
(43)
Pradeep K Thalla 1, Hicham Fadlallah, Benoit Liberelle, Pauline Lequoy, Gregory De Crescenzo, Yahye Merhi, Sophie Lerouge
Chondroitin sulfate coatings display low platelet but high endothelial cell adhesive properties favorable for vascular implants
Biomacromolecules. 2014 Jul 14;15(7):2512-20.
(44)
Louis Lippiello 
Collagen Synthesis in tenocytes, ligament cells and chondrocytes exposed to a combination of Glucosamine HCl and chondroitin sulfate
Evid Based Complement Alternat Med. 2007 Jun;4(2):219-24.
(45)
D Min 1 2, S Park 1, H Kim 3, S H Lee 1, Y Ahn 4, W Jung 4, H-J Kim 1, Y W Cho
Potential anti-ageing effect of chondroitin sulphate through skin regeneration
Int J Cosmet Sci. 2020 Oct;42(5):520-527
(46)
Huihua Yuan 1, Xiaolei Li 2, Ming-Song Lee 3, Zhuojun Zhang 4, Biyun Li 5, Hongyun Xuan 4, Wan-Ju Li 3, Yanzhong Zhang 6
Collagen and chondroitin sulfate functionalized bioinspired fibers for tendon tissue engineering application
Int J Biol Macromol. 2021 Feb 15:170:248-260.
(47)
R U Margolis 1, R K Margolis
Chondroitin sulfate proteoglycans as mediators of axon growth and pathfinding
Cell Tissue Res. 1997 Nov;290(2):343-8. 
(48)
Sarah Haylock-Jacobs 1, Michael B Keough, Lorraine Lau, V Wee Yong
Chondroitin sulphate proteoglycans: extracellular matrix proteins that regulate immunity of the central nervous system
Autoimmun Rev. 2011 Oct;10(12):766-72.
(49)
J L Funderburgh1
Keratan sulfate: structure, biosynthesis, and function
Glycobiology. 2000 Oct;10(10):951-8
(50)
Andrew J Quantock 1,✉, Robert D Young 1, Tomoya O Akama 
Structural and biochemical aspects of keratan sulphate in the cornea
Cell Mol Life Sci. 2009 Dec 27;67(6):891–906
(51)
D Heinegård, I Axelsson
Distribution of keratan sulfate in cartilage proteoglycans
J Biol Chem. 1977 Mar 25;252(6):1971-9.
(52)
Aurore Canoville 1 2, Lindsay E Zanno 1 2, Wenxia Zheng 2, Mary H Schweitzer 1 2
Keratan sulfate as a marker for medullary bone in fossil vertebrates
J Anat. 2021 Jun;238(6):1296-1311.
(53)
Haoqian Zhang 1, Kenji Uchimura, Kenji Kadomatsu
Brain keratan sulfate and glial scar formation
Ann N Y Acad Sci. 2006 Nov:1086:81-90
(54)
Vitor H Pomin 1
Keratan sulfate: an up-to-date review
Int J Biol Macromol. 2015 Jan:72:282-9. 
(55)
H Oxlund, T T Andreassen
The roles of hyaluronic acid, collagen and elastin in the mechanical properties of connective tissues.
J Anat. 1980 Dec;131(Pt 4):611–620.
(56)
Mirella Gouverneur 1, Jos A E Spaan, Hans Pannekoek, Ruud D Fontijn, Hans Vink
Fluid shear stress stimulates incorporation of hyaluronan into endothelial cell glycocalyx
Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2006 Jan;290(1):H458-2. 
(57)
Laura Koivusalo 1, Maija Kauppila 1, Sumanta Samanta 2, Vijay Singh Parihar 2, Tanja Ilmarinen 1, Susanna Miettinen 3, Oommen P Oommen 4, Heli Skottman 5
Tissue adhesive hyaluronic acid hydrogels for sutureless stem cell delivery and regeneration of corneal epithelium and stroma
Biomaterials. 2019 Dec:225:119516.
(58)
Hannah E John 1, Richard D Price 1,
Perspectives in the selection of hyaluronic acid fillers for facial wrinkles and aging skin
Patient Prefer Adherence. 2009 Nov 3;3:225–230.
(59)
T C LAURENT, M RYAN, A PIETRUSZKIEWICZ
Fractionation of hyaluronic acid. The polydispersity of hyaluronic acid from the bovine vitreous body
Biochim Biophys Acta. 1960 Aug 26:42:476-85.
(60)
J E Christner, M L Brown, D D Dziewiatkowski
Interaction of cartilage proteoglycans with hyaluronic acid. The role of the hyaluronic acid carboxyl groups
Biochem J. 1977 Dec 1;167(3):711-6. 
(61)
G Abatangelo, R Cortivo, M Martelli, P Vecchia
Cell detachment mediated by hyaluronic acid
Exp Cell Res. 1982 Jan;137(1):73-8.
(62)
Yue Leng 1, Ammara Abdullah 2, Michael K Wendt 2, Sarah Calve 1
Hyaluronic Acid, CD44 and RHAMM regulate myoblast behavior during embryogenesis
Matrix Biol. 2018 Aug 18;78-79:236–254.
(63)
S P Evanko 1, T N Wight
Intracellular localization of hyaluronan in proliferating cells
J Histochem Cytochem. 1999 Oct;47(10):1331-42. 
(64)
J A P Gomes 1, R Amankwah, A Powell-Richards, H S Dua
Sodium hyaluronate (hyaluronic acid) promotes migration of human corneal epithelial cells in vitro
Br J Ophthalmol. 2004 Jun;88(6):821-5. 
(65)
Simran Gagneja 1, Neena Capalash 2, Prince Sharma
Hyaluronic acid as a tumor progression agent and a potential chemotherapeutic biomolecule against cancer: A review on its dual role
Int J Biol Macromol. 2024 Aug;275(Pt 2):133744
(66)
Jing Wang 1, Dan Liu 2, Shuang Guan 3, Wenquan Zhu 4, Li Fan 5, Qi Zhang 6, Defu Cai 7
Hyaluronic acid-modified liposomal honokiol nanocarrier: Enhance anti-metastasis and antitumor efficacy against breast cancer
Carbohydr Polym. 2020 May 1:235:115981
(67)
P H Weigel 1, S J Frost, C T McGary, R D LeBoeuf
The role of hyaluronic acid in inflammation and wound healing
Int J Tissue React. 1988;10(6):355-65.
(68)
Swapna Neela, Parijatha Bandigari, Konda Mayuri*
Collagen – A Review
(69)
A. K. Gulevsky I. I. Shcheniavsky 
COLLAGEN: STRUCTURE, METABOLISM, PRODUCTION AND INDUSTRIAL APPLICATION
(70)
D A Parry 1
The molecular and fibrillar structure of collagen and its relationship to the mechanical properties of connective tissue
Biophys Chem. 1988 Feb;29(1-2):195-209.
(71)
David A. D. Parry & Alan S. Craig 
Growth and development of collagen fibrils in connective tissue]
Ultrastructure of the Connective Tissue Matrix pp 34–64
(72)
Zbigniew Ruszczak
Effect of collagen matrices on dermal wound healing
Adv Drug Deliv Rev. 2003 Nov 28;55(12):1595-611. 
(73)
S Viguet-Carrin 1, P Garnero, P D Delmas
The role of collagen in bone strength
Osteoporos Int. 2006;17(3):319-36.
(74)
Marco Franchi 1, Alessandra Trirè, Marilisa Quaranta, Ester Orsini, Victoria Ottani
Collagen structure of tendon relates to function
ScientificWorldJournal. 2007 Mar 30:7:404-20.
(75)
David Eyre
Articular cartilage and changes in Arthritis: Collagen of articular cartilage
Arthritis Research & Therapy volume 4, Article number: 30 (2001)
(76)
B Brodsky 1, J A Ramshaw
The collagen triple-helix structure
Matrix Biol. 1997 Mar;15(8-9):545-54. 
(77)
Matthew D Shoulders 1, Ronald T Raines
Collagen structure and stability
Annu Rev Biochem. 2009:78:929-58.
(78)
Moti L. Tikua,, Balaraman Madhan
Preserving the longevity of long-lived type II collagen and its implication for cartilage therapeutics
Ageing Research Reviews Volume 28, July 2016, Pages 62-71
(79)
Marlyn Wu; Kelly Cronin; Jonathan S. Crane.
Biochemistry, Collagen Synthesis
StatPearls [Internet]
(80)
Ana Marina Ferreira 1, Piergiorgio Gentile, Valeria Chiono, Gianluca Ciardelli
Collagen for bone tissue regeneration
Acta Biomater. 2012 Sep;8(9):3191-200.
(81)
John M Rhodes 1, Michael Simons
The extracellular matrix and blood vessel formation: not just a scaffold
J Cell Mol Med. 2007 Mar-Apr;11(2):176-205.
(82)
Jyrki Heino 1
The collagen family members as cell adhesion proteins
Bioessays. 2007 Oct;29(10):1001-10.
(82)
Nadine Rommerswinkel 1, Bernd Niggemann 1, Silvia Keil 1, Kurt S Zänker 1, Thomas Dittmar 1
Analysis of Cell Migration within a Three-dimensional Collagen Matrix
J Vis Exp. 2014 Oct 5;(92):51963
(83)
Nynke A Hosper 1, Paul P van den Berg, Saskia de Rond, Eliane R Popa, Martijn J Wilmer, Rosalinde Masereeuw, Ruud A Bank
Epithelial-to-mesenchymal transition in fibrosis: collagen type I expression is highly upregulated after EMT, but does not contribute to collagen deposition
Exp Cell Res. 2013 Nov 15;319(19):3000-9.
(84)
Nadine Rommerswinkel 1, Bernd Niggemann 1, Silvia Keil 1, Kurt S Zänker 1, Thomas Dittmar 1
Analysis of Cell Migration within a Three-dimensional Collagen Matrix
J Vis Exp. 2014 Oct 5;(92):51963.
(85)
Gaofeng Xiong 1 2, Jie Chen 1 2, Guoying Zhang 3, Shike Wang 1 2, Kunito Kawasaki 4, Jieqing Zhu 1 2, Yan Zhang 3, Kazuhiro Nagata 4, Zhenyu Li 3, Binhua P Zhou 1 5, Ren Xu 6 2
Hsp47 promotes cancer metastasis by enhancing collagen-dependent cancer cell-platelet interaction
Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 Feb 18;117(7):3748-3758.
(86)
A. H. Reddi 
Collagen and Cell Differentiation
Biochemistry of Collagen
(87)
Sophia Harrison 1, Patrick Vavken, Sherwin Kevy, May Jacobson, David Zurakowski, Martha M Murray
Platelet activation by collagen provides sustained release of anabolic cytokines
Am J Sports Med. 2011 Apr;39(4):729-34
(88)
Sakurako Kobayashi # 1, Nobuhiko Ogasawara # 1, Satoshi Watanabe 1, Yosuke Yoneyama 2, Sakura Kirino 1, Yui Hiraguri 1, Masami Inoue 1, Sayaka Nagata 1, Yoshimi Okamoto-Uchida 3, Satoshi Kofuji 3, Hiromichi Shimizu 4, Go Ito 5, Tomohiro Mizutani 1, Shinichi Yamauchi 6, Yusuke Kinugasa 6, Yoshihito Kano 7, Yasuhiro Nemoto 1, Mamoru Watanabe 5, Kiichiro Tsuchiya 8, Hiroshi Nishina 3, Ryuichi Okamoto 9, Shiro Yui 10
Collagen type I-mediated mechanotransduction controls epithelial cell fate conversion during intestinal inflammation
Inflamm Regen. 2022 Nov 28;42(1):49
(89)
Jean Claude Monboisse 1, Jean Baptiste Oudart 1, Laurent Ramont 1, Sylvie Brassart-Pasco 2, François Xavier Maquart 
Matrikines from basement membrane collagens: a new anti-cancer strategy
Biochim Biophys Acta. 2014 Aug;1840(8):2589-98
(90)
H Sage
Collagens of basement membranes
J Invest Dermatol. 1982 Jul:79 Suppl 1:51s-59s.
(91)
Hanna Trębacz 1,*, Angelika Barzycka
Mechanical Properties and Functions of Elastin: An Overview
Biomolecules. 2023 Mar 22;13(3):574.
(92)
Sarah RauscherRégis Pomès 
The liquid structure of elastin
eLife. 2017 Nov 9;6:e26526.
(93)
Andrea Heinz 1
Elastases and elastokines: elastin degradation and its significance in health and disease
Crit Rev Biochem Mol Biol. 2020 Jun;55(3):252-273
(94)
Mario Lescan 1, Regine Mariette Perl 1, Sonia Golombek 1, Martin Pilz 1, Ludmilla Hann 1, Mahua Yasmin 1, Andreas Behring 1, Timea Keller 1, Andrea Nolte 1, Franziska Gruhn 1, Efrat Kochba 2, Yotam Levin 2, Christian Schlensak 1, Hans Peter Wendel 1, Meltem Avci-Adali 1,∗
De Novo Synthesis of Elastin by Exogenous Delivery of Synthetic Modified mRNA into Skin and Elastin-Deficient Cells
Mol Ther Nucleic Acids. 2018 Mar 30;11:475–484.
(95)
Arnaud Robinet 1, Abdel Fahem, Jean-Hubert Cauchard, Eric Huet, Loïc Vincent, Sandrine Lorimier, Franck Antonicelli, Claudine Soria, Michel Crepin, William Hornebeck, Georges Bellon
Elastin-derived peptides enhance angiogenesis by promoting endothelial cell migration and tubulogenesis through upregulation of MT1-MMP
J Cell Sci. 2005 Jan 15;118(Pt 2):343-56
(96)
Ursula R Rodgers 1, Anthony S Weiss
Cellular interactions with elastin
Pathol Biol (Paris). 2005 Sep;53(7):390-8.
(97)
A J Bank 1, H Wang, J E Holte, K Mullen, R Shammas, S H Kubo
Contribution of collagen, elastin, and smooth muscle to in vivo human brachial artery wall stress and elastic modulus
Circulation. 1996 Dec 15;94(12):3263-70.
(98)
R M Senior, G L Griffin, R P Mecham
Chemotactic activity of elastin-derived peptides
J Clin Invest. 1980 Oct;66(4):859-62. 
(99)
Belinda J Joyce 1, Megan J Wallace, Richard A Pierce, Richard Harding, Stuart B Hooper
Sustained changes in lung expansion alter tropoelastin mRNA levels and elastin content in fetal sheep lungs
Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. 2003 Apr;284(4):L643-9.
(100)
J. M. Davidson 
Elastin and the Lung
Biochemistry of Pulmonary Emphysema pp 13–25
(101)
Tomohiro Mizuno 1, Terrence M Yau, Richard D Weisel, Chris G Kiani, Ren-Ke Li
Elastin stabilizes an infarct and preserves ventricular function
Circulation. 2005 Aug 30;112(9 Suppl):I81-8.
(102)
Anna Gilbert 1, Aleksandra Wyczalkowska-Tomasik 2, Malgorzata Zendzian-Piotrowska 3, Bozena Czarkowska-Paczek 4
Training differentially regulates elastin level and proteolysis in skeletal and heart muscles and aorta in healthy rats
Biol Open. 2016 May 15;5(5):556-62.
(103)
Luai Huleihel 1,2, George S Hussey 1,2, Juan Diego Naranjo 1,2, Li Zhang 1,2, Jenna L Dziki 1,3, Neill J Turner 1,2, Donna B Stolz 4,5, Stephen F Badylak 1,
Matrix-bound nanovesicles within ECM bioscaffolds
Sci Adv. 2016 Jun 10;2(6):e1600502.
(104)
Ilea T Swinehart 1, Stephen F Badylak
Extracellular matrix bioscaffolds in tissue remodeling and morphogenesis
Dev Dyn. 2016 Jan 13;245(3):351–360
(105)
Luai Huleihel 1, Jenna L Dziki 2, Joseph G Bartolacci 3, Theresa Rausch 3, Michelle E Scarritt 1, Madeline C Cramer 3, Tatiana Vorobyov 4, Samuel T LoPresti 2, Ilea T Swineheart 3, Lisa J White 5, Bryan N Brown 6, Stephen F Badylak 7
Macrophage phenotype in response to ECM bioscaffolds
Semin Immunol. 2017 Feb:29:2-13. 
(106)
Jenna L Dziki 1,,2, Luai Huleihel 1, Michelle E Scarritt 1,,3, Stephen F Badylak
Extracellular Matrix Bioscaffolds as Immunomodulatory Biomaterials
Tissue Eng Part A. 2017 Oct 1;23(19-20):1152–1159.
(107)
Evangelos Liamas, Richard A. Black, Paul A. Mulheran, Robert Tampé, Ralph Wieneke, Owen R. T. Thomas & Zhenyu J. Zhang
Probing fibronectin adsorption on chemically defined surfaces by means of single molecule force microscopy
Scientific Reports volume 10, Article number: 15662 (2020) 
(108)
H P Erickson, N Carrell, J McDonagh
Fibronectin molecule visualized in electron microscopy: a long, thin, flexible strand
J Cell Biol. 1981 Dec;91(3 Pt 1):673-78.
(109)
E Osterlund
The secondary structure of human plasma fibronectin: conformational changes induced by acidic pH and elevated temperatures; a circular dichroic study
Biochim Biophys Acta. 1988 Aug 10;955(3):330-6.
(110)
K Ichihara-Tanaka 1, T Maeda, K Titani, K Sekiguchi
Matrix assembly of recombinant fibronectin polypeptide consisting of amino-terminal 70 kDa and carboxyl-terminal 37 kDa regions
FEBS Lett. 1992 Mar 9;299(2):155-8. 
(111)
Tomoo Ohashi 1,*, Harold P Erickson 
Revisiting the mystery of fibronectin multimers: the fibronectin matrix is composed of fibronectin dimers cross-linked by non-covalent bonds
Matrix Biol. 2009 Mar 12;28(3):170–175
(112)
S Johansson 1, G Svineng, K Wennerberg, A Armulik, L Lohikangas
Fibronectin-integrin interactions
Front Biosci. 1997 Mar 1:2:d126-46.
(113)
L I Gold, E Pearlstein
Fibronectin-collagen binding and requirement during cellular adhesion
Biochem J. 1980 Feb 15;186(2):551-9.
(114)
J W Tamkun, R O Hynes
Plasma fibronectin is synthesized and secreted by hepatocytes
J Biol Chem. 1983 Apr 10;258(7):4641-7.
(115)
Heyu Ni 1, Peter S T Yuen, Jessie M Papalia, Jane E Trevithick, Takao Sakai, Reinhard Fässler, Richard O Hynes, Denisa D Wagner
Plasma fibronectin promotes thrombus growth and stability in injured arterioles
Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 Mar 4;100(5):2415-9.
(116)
Lisa M Maurer 1, Wenjiang Ma 1, Deane F Mosher 1,*
Dynamic Structure of Plasma Fibronectin
Crit Rev Biochem Mol Biol. 2016 May 17;51(4):213–227.
(117)
E C Williams, P A Janmey, J D Ferry, D F Mosher
Conformational states of fibronectin. Effects of pH, ionic strength, and collagen binding
J Biol Chem. 1982 Dec 25;257(24):14973-8.
(118)
Klára Briknarová 1, Maria E Akerman, David W Hoyt, Erkki Ruoslahti, Kathryn R Ely
Anastellin, an FN3 fragment with fibronectin polymerization activity, resembles amyloid fibril precursors
J Mol Biol. 2003 Sep 5;332(1):205-15.
(119)
R P Hershberger and L A Culp
Cell-type-specific expression of alternatively spliced human fibronectin IIICS mRNAs.
Mol Cell Biol. 1990 Feb; 10(2): 662–671.
(120)
A L Gehris 1, S A Oberlender, K J Shepley, R S Tuan, V D Bennett
Fibronectin mRNA alternative splicing is temporally and spatially regulated during chondrogenesis in vivo and in vitro
Dev Dyn. 1996 Jun;206(2):219-30.
(121)
E Ruoslahti
Fibronectin in cell adhesion and invasion
Cancer Metastasis Rev. 1984;3(1):43-51.
(122)
S W Han 1, J Roman
Fibronectin induces cell proliferation and inhibits apoptosis in human bronchial epithelial cells: pro-oncogenic effects mediated by PI3-kinase and NF-kappa B
Oncogene. 2006 Jul 20;25(31):4341-9.
(123)
I I Singer 1, S Scott, D W Kawka, D M Kazazis, J Gailit, E Ruoslahti
Cell surface distribution of fibronectin and vitronectin receptors depends on substrate composition and extracellular matrix accumulation
J Cell Biol. 1988 Jun;106(6):2171-82.
(124)
E H Danen 1, K M Yamada
Fibronectin, integrins, and growth control
J Cell Physiol. 2001 Oct;189(1):1-13.
(125)
M Aumailley 1, N Smyth
The role of laminins in basement membrane function
J Anat. 1998 Jul;193 ( Pt 1)(Pt 1):1-21. 
(126)
H Colognato 1, P D Yurchenco
Form and function: the laminin family of heterotrimers
Dev Dyn. 2000 Jun;218(2):213-34.
(127)
Y S Cheng 1, M F Champliaud, R E Burgeson, M P Marinkovich, P D Yurchenco
Self-assembly of laminin isoforms
J Biol Chem. 1997 Dec 12;272(50):31525-32. 
(128)
Masashi Yamada 1, Kiyotoshi Sekiguchi 
Molecular Basis of Laminin-Integrin Interactions
Curr Top Membr. 2015:76:197-229. 
(129)
Erhard Hohenester
Laminin G-like domains: dystroglycan-specific lectins
Curr Opin Struct Biol. 2019 Jun:56:56-63. 
(130)
Wikipedia
Laminin
(131)
N Boudreau 1, C Myers, M J Bissell
From laminin to lamin: regulation of tissue-specific gene expression by the ECM
Trends Cell Biol. 1995 Jan;5(1):1-4.
(132)
Jeffrey H Miner *, Jeanette Cunningham ‡, Joshua R Sanes ‡
Roles for Laminin in Embryogenesis: Exencephaly, Syndactyly, and Placentopathy in Mice Lacking the Laminin α5 Chain
J Cell Biol. 1998 Dec 14;143(6):1713–1723.
(133)
L Luckenbill-Edds 
Laminin and the mechanism of neuronal outgrowth
Brain Res Brain Res Rev. 1997 Feb;23(1-2):1-27.
(134)
J F Riou 1, M Umbhauer, D L Shi, J C Boucaut
Tenascin: a potential modulator of cell-extracellular matrix interactions during vertebrate embryogenesis
Biol Cell. 1992;75(1):1-9
(135)
Sean P Giblin 1, Kim S Midwood
Tenascin-C: Form versus function
Cell Adh Migr. 2015;9(1-2):48-82
(136)
Alison Woodworth 1, Penka Pesheva, Dorothy Fiete, Jacques U Baenziger
Neuronal-specific synthesis and glycosylation of tenascin-R
J Biol Chem. 2004 Mar 12;279(11):10413-21
(137)
Ulrich Valcourt, Lindsay B Alcaraz, Jean-Yves Exposito, Claire Lethias, and Laurent Bartholin
Tenascin-X: beyond the architectural function
Cell Adhesion & Migration 9:1-2, 154--165; January – April 2015
(138)
K Matsumoto 1, Y Saga, T Ikemura, T Sakakura, R Chiquet-Ehrismann
The distribution of tenascin-X is distinct and often reciprocal to that of tenascin-C
J Cell Biol. 1994 Apr;125(2):483-93
(139)
A Scherberich 1, R P Tucker, E Samandari, M Brown-Luedi, D Martin, R Chiquet-Ehrismann
Murine tenascin-W: a novel mammalian tenascin expressed in kidney and at sites of bone and smooth muscle development
J Cell Sci. 2004 Feb 1;117(Pt 4):571-81. 
(140)
Michael Karus 1, Bernd Denecke, Charles ffrench-Constant, Stefan Wiese, Andreas Faissner
The extracellular matrix molecule tenascin C modulates expression levels and territories of key patterning genes during spinal cord astrocyte specification
Development. 2011 Dec;138(24):5321-31
(141)
Agata Radwanska, Dominique Grall, Sébastien Schaub, Stéphanie Beghelli-de la Forest Divonne, Delphine Ciais, Samah Rekima, Tristan Rupp, Anne Sudaka, Gertraud Orend & Ellen Van Obberghen-Schilling
Counterbalancing anti-adhesive effects of Tenascin-C through fibronectin expression in endothelial cells
Scientific Reports volume 7, Article number: 12762 (2017) 
(142)
Ayaka Ohashi 1, Suzuno Terai 2, Saya Furukawa 1, Sakiya Yamamoto 1, Rena Kashimoto 1, Akira Satoh 3
Tenascin-C-enriched regeneration-specific extracellular matrix guarantees superior muscle regeneration in Ambystoma mexicanum
Dev Biol. 2023 Dec:504:98-112. 
(143)
C M Webb 1, G Zaman, J R Mosley, R P Tucker, L E Lanyon, E J Mackie
Expression of tenascin-C in bones responding to mechanical load
J Bone Miner Res. 1997 Jan;12(1):52-8. 
(144)
WH Lewis 
The adhesive quality of cells
Anat Rec. 23 (7): 387–392.(1922)
(145)
Karl Meyer, Dickinson W. Richards, and Stanley E. Bradley
Extracellular Matrices
Science vol.147 pp.760-761 (1965)
(146)
Alexandra Naba
Mechanisms of assembly and remodelling of the extracellular matrix
Nature Reviews Molecular Cell Biology volume 25, pages865–885 (2024)
(147)
Graham W Draper 1, Deborah K Shoemark 1, Josephine C Adams
Modelling the early evolution of extracellular matrix from modern Ctenophores and Sponges
Essays Biochem. 2019 Sep 13;63(3):389-405. 
(148)
Julie Huxley-Jones 1, John W Pinney, John Archer, David L Robertson, Raymond P Boot-Handford
Back to basics--how the evolution of the extracellular matrix underpinned vertebrate evolution
Int J Exp Pathol. 2009 Apr;90(2):95-100.
(149)
Richard O Hynes 1
The evolution of metazoan extracellular matrix
J Cell Biol. 2012 Mar 19;196(6):671-9
(150)
J L Ashworth 1, G Murphy 1, M J Rock 1, M J Sherratt 1, S D Shapiro 1, C A Shuttleworth 1, C M Kielty 1
Fibrillin degradation by matrix metalloproteinases: implications for connective tissue remodelling.
Biochem J. 1999 May 15;340(Pt 1):171–181.
(151)
Yue Zhang 1, Xiao-Jing Liu 2, Xin-Ran Zhai 2, Yao Yao 1, Bin Shao 2, Yu-Han Zhen 2, Xin Zhang 2, Zhe Xiao 1, Li-Fang Wang 1, Ming-Lian Zhang 1, Zhi-Min Chen 1
Knockdown of fibrillin-1 suppresses retina-blood barrier dysfunction by inhibiting vascular endothelial apoptosis under diabetic conditions
Int J Ophthalmol. 2024 Aug 18;17(8):1403-1410
(152)
Alan R F Godwin 1, Mukti Singh 1, Michael P Lockhart-Cairns 1, Yasmene F Alanazi 1, Stuart A Cain 2, Clair Baldock 3
The role of fibrillin and microfibril binding proteins in elastin and elastic fibre assembly
Matrix Biol. 2019 Nov:84:17-30.
(153)
B L Loeys 1, E E Gerber, D Riegert-Johnson, S Iqbal, P Whiteman, V McConnell, C R Chillakuri, D Macaya, P J Coucke, A De Paepe, D P Judge, F Wigley, E C Davis, H J Mardon, P Handford, D R Keene, L Y Sakai, H C Dietz
Mutations in fibrillin-1 cause congenital scleroderma: stiff skin syndrome
Sci Transl Med. 2010 Mar 17;2(23):23ra20.
(154)
Florian Alonso 1 2, Yuechao Dong 1 2, Ling Li 3, Tiya Jahjah 1 2, Jean-William Dupuy 1, Isabelle Fremaux 1 2, Dieter P Reinhardt 3 4, Elisabeth Génot
Fibrillin-1 regulates endothelial sprouting during angiogenesis
Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 Jun 6;120(23):e2221742120.
(155)
Shazia S Chaudhry 1,2, Stuart A Cain 1, Amanda Morgan 1, Sarah L Dallas 3, C Adrian Shuttleworth 1, Cay M Kielty 1,
Fibrillin-1 regulates the bioavailability of TGFβ1
J Cell Biol. 2007 Jan 29;176(3):355–367.
(156)
Daniela Orellana-Guerrero 1, Jose Miguel Uribe-Salazar 2, Pouya Dini
The potential role of Fibrillin 2 in equine placental and fetal development
Journal of Equine Veterinary Science Volume 125, June 2023, 104778
(157)
Alexandra Naba 1, Karl R Clauser, Sebastian Hoersch, Hui Liu, Steven A Carr, Richard O Hynes
The matrisome: in silico definition and in vivo characterization by proteomics of normal and tumor extracellular matrices
Mol Cell Proteomics. 2012 Apr;11(4):M111.014647.
(158)
Matthew D Shoulders 1, Ronald T Raines
Collagen structure and stability
Annu Rev Biochem. 2009:78:929-58.
(159)
Ryoko Nishiuchi 1, Junichi Takagi, Maria Hayashi, Hiroyuki Ido, Yoshiko Yagi, Noriko Sanzen, Tsutomu Tsuji, Masashi Yamada, Kiyotoshi Sekiguchi
Ligand-binding specificities of laminin-binding integrins: a comprehensive survey of laminin-integrin interactions using recombinant alpha3beta1, alpha6beta1, alpha7beta1 and alpha6beta4 integrins
Matrix Biol. 2006 Apr;25(3):189-97.
(160)
Erhard Hohenester 1,✉
Structural biology of laminins
Essays Biochem. 2019 May 15;63(3):285–295. 
(161)
Zeinab Rekad 1, Valerio Izzi 2, Rijuta Lamba 3, Delphine Ciais 1, Ellen Van Obberghen-Schilling 
The alternative matrisome: Alternative splicing of ECM proteins in development, homeostasis and tumor progression
Matrix Biol. 2022 Aug:111:26-52.
(162)
Patrick A Murphy 1 2, Noor Jailkhani 1, Sarah-Anne Nicholas 2, Amanda M Del Rosario 1, Jeremy L Balsbaugh 3, Shahinoor Begum 1 4, Amy Kimble 2, Richard O Hynes 1 
Alternative Splicing of FN (Fibronectin) Regulates the Composition of the Arterial Wall Under Low Flow
Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2021 Jan;41(1):e18-e32
(163)
B M Machiels 1, A H Zorenc, J M Endert, H J Kuijpers, G J van Eys, F C Ramaekers, J L Broers
An alternative splicing product of the lamin A/C gene lacks exon 10
J Biol Chem. 1996 Apr 19;271(16):9249-53. 
(164)
M Metsäranta 1, D Toman, B de Crombrugghe, E Vuorio
Mouse type II collagen gene. Complete nucleotide sequence, exon structure, and alternative splicing
J Biol Chem. 1991 Sep 5;266(25):16862-9.
(165)
Z Indik 1, H Yeh, N Ornstein-Goldstein, U Kucich, W Abrams, J C Rosenbloom, J Rosenbloom
Structure of the elastin gene and alternative splicing of elastin mRNA: implications for human disease
Am J Med Genet. 1989 Sep;34(1):81-90. 
(166)
Mitsuo Yamauchi & Masashi Shiiba 
Lysine Hydroxylation and Cross-linking of Collagen
Post-translational Modifications of Proteins pp 95–108
(167)
Boushra Bathish 1, Martina Paumann-Page 1, Louise N Paton 1, Anthony J Kettle 1, Christine C Winterbourn 2
Peroxidasin mediates bromination of tyrosine residues in the extracellular matrix
J Biol Chem. 2020 Sep 4;295(36):12697-12705.
(168)
A Scott McCall 1,†, Christopher F Cummings 2,3,†, Gautam Bhave 3,†, Roberto Vanacore 3,4, Andrea Page-McCaw 5,6,7, Billy G Hudson 2,3
Bromine is an essential trace element for assembly of collagen IV scaffolds in tissue development and architecture
Cell. 2014 Jun 5;157(6):1380–1392. 
(169)
Xiaoke Li 1, Jiang Chang
Preparation of bone-like apatite-collagen nanocomposites by a biomimetic process with phosphorylated collagen
J Biomed Mater Res A. 2008 May;85(2):293-300. 
(170)
Dong Fang 1, Cong Pan, Huijuan Lin, Ya Lin, Guangrui Xu, Guiyou Zhang, Hongzhong Wang, Liping Xie, Rongqing Zhang
Ubiquitylation functions in the calcium carbonate biomineralization in the extracellular matrix
PLoS One. 2012;7(4):e35715.
(171)
G D Wilner, H L Nossel, E C LeRoy
Aggregation of platelets by collagen
J Clin Invest. 1968 Dec;47(12):2616-21.
(172)
Maria E Vega 1, Birgit Kastberger 2, Bernhard Wehrle-Haller 2, Jean E Schwarzbauer 1
Stimulation of Fibronectin Matrix Assembly by Lysine Acetylation
Cells. 2020 Mar 8;9(3):655.
(173)
Ranjay Jayadev 1,†, Mychel R P T Morais 2,†, Jamie M Ellingford 3,4,†, Sandhya Srinivasan 1, Richard W Naylor 2, Craig Lawless 2, Anna S Li 2, Jack F Ingham 2, Eric Hastie 1, Qiuyi Chi 1, Maryline Fresquet 2, Nikki-Maria Koudis 2, Huw B Thomas 4, Raymond T O’Keefe 4, Emily Williams 2, Antony Adamson 5, Helen M Stuart 3,4, Siddharth Banka 3,4, Damian Smedley 6; Genomics England Research Consortium6,7, David R Sherwood 1,*, Rachel Lennon 2,8,
A basement membrane discovery pipeline uncovers network complexity, regulators, and human disease associations
Sci Adv. 2022 May 18;8(20):eabn2265
(174)
Katherine E Hill 1, Benjamin M Lovett 1, Jean E Schwarzbauer
Heparan sulfate is necessary for the early formation of nascent fibronectin and collagen I fibrils at matrix assembly sites
J Biol Chem. 2022 Jan;298(1):101479.
(175)
Sanjay Kumar 1, Valerie M Weaver
Mechanics, malignancy, and metastasis: the force journey of a tumor cell
Cancer Metastasis Rev. 2009 Jun;28(1-2):113-27.
(176)
Leandro Moretti 1, Jack Stalfort 1, Thomas Harrison Barker 1, Daniel Abebayehu 2
The interplay of fibroblasts, the extracellular matrix, and inflammation in scar formation
J Biol Chem. 2022 Feb;298(2):101530. 
(177)
Jeremy Herrera, Craig A Henke, Peter B Bitterman
Extracellular matrix as a driver of progressive fibrosis
J Clin Invest. 2018 Jan 2;128(1):45-53.
(178)
Erik Henke 1,*, Rajender Nandigama 1, Süleyman Ergün 1
Extracellular Matrix in the Tumor Microenvironment and Its Impact on Cancer Therapy
Front Mol Biosci. 2020 Jan 31;6:160
(179)
Boer Deng 1 2, Ziyi Zhao 1 2, Weimin Kong 3 4, Chao Han 1, Xiaochang Shen 1 2, Chunxiao Zhou 
Biological role of matrix stiffness in tumor growth and treatment
J Transl Med. 2022 Nov 22;20(1):540.
(180)
Alfonso Gautieri 1, Alberto Redaelli 2, Markus J Buehler 3, Simone Vesentini 2
Age- and diabetes-related nonenzymatic crosslinks in collagen fibrils: candidate amino acids involved in Advanced Glycation End-products
Matrix Biol. 2014 Feb:34:89-95. 
(181)
Xinhao Shao 1, Clarissa D Gomez 2, Nandini Kapoor 2, James M Considine 2, Christopher Grams 1, Yu Tom Gao 1 3, Alexandra Naba 
MatrisomeDB 2.0: 2023 updates to the ECM-protein knowledge database
Nucleic Acids Res. 2023 Jan 6;51(D1):D1519-D1530.
(182)
Bernard Grillet 1, Rafaela Vaz Sousa Pereira 1, Jo Van Damme 2, Ahmed Abu El-Asrar 1 2 3, Paul Proost 2, Ghislain Opdenakker 4 5 
Matrix metalloproteinases in arthritis: towards precision medicine
Nat Rev Rheumatol. 2023 Jun;19(6):363-377.
(183)
Emma Åhrman 1, Oskar Hallgren 2, Lars Malmström 3, Ulf Hedström 4, Anders Malmström 5, Leif Bjermer 2, Xiao-Hong Zhou 6, Gunilla Westergren-Thorsson 7, Johan Malmström 8
Quantitative proteomic characterization of the lung extracellular matrix in chronic obstructive pulmonary disease and idiopathic pulmonary fibrosis
J Proteomics. 2018 Oct 30:189:23-33
(184)
M G Belvisi 1, K M Bottomley
The role of matrix metalloproteinases (MMPs) in the pathophysiology of chronic obstructive pulmonary disease (COPD): a therapeutic role for inhibitors of MMPs?
Inflamm Res. 2003 Mar;52(3):95-100.
(185)
Susanne Renaud 1, David Leppert
Matrix metalloproteinases in neuromuscular disease
Muscle Nerve. 2007 Jul;36(1):1-13.
(186)
Peter Liu 1,✉, Mei Sun 1, Sawsan Sader 1
Matrix metalloproteinases in cardiovascular disease
Can J Cardiol. 2006 Feb;22(Suppl B):25B–30B.
(187)
Francis J Alenghat 1, Donald E Ingber
Mechanotransduction: all signals point to cytoskeleton, matrix, and integrins
Sci STKE. 2002 Feb 12;2002(119):pe6.
(188)
James W. Fawcett, Toshitaka Oohashi & Tommaso Pizzorusso 
The roles of perineuronal nets and the perinodal extracellular matrix in neuronal function
Nature Reviews Neuroscience volume 20, pages451–465 (2019)
(189)
C Jäger 1, D Lendvai, G Seeger, G Brückner, R T Matthews, T Arendt, A Alpár, M Morawski
Perineuronal and perisynaptic extracellular matrix in the human spinal cord
Neuroscience. 2013 May 15:238:168-84
(190)
M R Celio 1, R Spreafico, S De Biasi, L Vitellaro-Zuccarello
Perineuronal nets: past and present
Trends Neurosci. 1998 Dec;21(12):510-5
(191)
Russell T Matthews 1, Gail M Kelly, Cynthia A Zerillo, Grace Gray, Michael Tiemeyer, Susan Hockfield
Aggrecan glycoforms contribute to the molecular heterogeneity of perineuronal nets
J Neurosci. 2002 Sep 1;22(17):7536-47
(192)
Afia B Ali 1, Anam Islam 1, Andrew Constanti
The fate of interneurons, GABAA receptor sub-types and perineuronal nets in Alzheimer's disease
Brain Pathol. 2023 Jan;33(1):e13129.
(193)
Daniela Carulli 1 2, Joost Verhaagen
An Extracellular Perspective on CNS Maturation: Perineuronal Nets and the Control of Plasticity
Int J Mol Sci. 2021 Feb 28;22(5):2434.
(194)
Toshitaka Oohashi 1, Satoshi Hirakawa, Yoko Bekku, Uwe Rauch, Dieter R Zimmermann, Wei-Dong Su, Aiji Ohtsuka, Takuro Murakami, Yoshifumi Ninomiya
Bral1, a brain-specific link protein, colocalizing with the versican V2 isoform at the nodes of Ranvier in developing and adult mouse central nervous systems
Mol Cell Neurosci. 2002 Jan;19(1):43-57. 
(195)
Barbara A Sorg 1, Sabina Berretta 2, Jordan M Blacktop 3, James W Fawcett 4, Hiroshi Kitagawa 5, Jessica C F Kwok 6, Marta Miquel 7
Casting a Wide Net: Role of Perineuronal Nets in Neural Plasticity
J Neurosci. 2016 Nov 9;36(45):11459-11468.
(196)
Harry Pantazopoulos 1,2, Sabina Berretta 1,2
In Sickness and in Health: Perineuronal Nets and Synaptic Plasticity in Psychiatric Disorders
Neural Plast. 2015 Dec 29;2016:9847696.
(197)
Emilia Favuzzi 1, André Marques-Smith 2, Rubén Deogracias 1, Christian M Winterflood 3, Alberto Sánchez-Aguilera 2, Laura Mantoan 4, Patricia Maeso 1, Cathy Fernandes 5, Helge Ewers 6, Beatriz Rico 7
Activity-Dependent Gating of Parvalbumin Interneuron Function by the Perineuronal Net Protein Brevican
Neuron. 2017 Aug 2;95(3):639-655.e10. 
(198)
James W. Fawcett, Marianne Fyhn, Pavla Jendelova, Jessica C. F. Kwok, Jiri Ruzicka & Barbara A. Sorg 
The extracellular matrix and perineuronal nets in memory
Molecular Psychiatry volume 27, pages3192–3203 (2022)
(199)
Gregory M Miller 1, Linda C Hsieh-Wilson
Sugar-dependent modulation of neuronal development, regeneration, and plasticity by chondroitin sulfate proteoglycans
Exp Neurol. 2015 Dec;274(Pt B):115-25.
(200)
Calvin C Smith 1, Rui Mauricio 1, Luis Nobre 1, Barnaby Marsh 1, Rob C I Wüst 1, Harry B Rossiter 2, Ronaldo M Ichiyama 3
Differential regulation of perineuronal nets in the brain and spinal cord with exercise training
Brain Res Bull. 2015 Feb:111:20-6.
(201)
Difei Wang 1, Ronaldo M Ichiyama, Rongrong Zhao, Melissa R Andrews, James W Fawcett
Chondroitinase combined with rehabilitation promotes recovery of forelimb function in rats with chronic spinal cord injury
J Neurosci. 2011 Jun 22;31(25):9332-44. 
(202)
Cord Brakebusch 1, Constanze I Seidenbecher, Fredrik Asztely, Uwe Rauch, Henry Matthies, Hannelore Meyer, Manfred Krug, Tobias M Böckers, Xiaohong Zhou, Michael R Kreutz, Dirk Montag, Eckart D Gundelfinger, Reinhard Fässler
Brevican-deficient mice display impaired hippocampal CA1 long-term potentiation but show no obvious deficits in learning and memory
Mol Cell Biol. 2002 Nov;22(21):7417-27.
(203)
X H Zhou 1, C Brakebusch, H Matthies, T Oohashi, E Hirsch, M Moser, M Krug, C I Seidenbecher, T M Boeckers, U Rauch, R Buettner, E D Gundelfinger, R Fässler
Neurocan is dispensable for brain development
Mol Cell Biol. 2001 Sep;21(17):5970-8.
(204)
Daniela Carulli 1 2, Joost Verhaagen 1
An Extracellular Perspective on CNS Maturation: Perineuronal Nets and the Control of Plasticity
Int J Mol Sci. 2021 Feb 28;22(5):2434
(205)
Jan-Harry Cabungcal 1, Pascal Steullet, Hirofumi Morishita, Rudolf Kraftsik, Michel Cuenod, Takao K Hensch, Kim Q Do
Perineuronal nets protect fast-spiking interneurons against oxidative stress
Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 May 28;110(22):9130-5.
(206)
Anne Suttkus 1, Markus Morawski 2, Thomas Arendt 2
Protective Properties of Neural Extracellular Matrix
Mol Neurobiol. 2016 Jan;53(1):73-82
(207)
Markus Morawski 1, Gert Brückner, Carsten Jäger, Gudrun Seeger, Russel T Matthews, Thomas Arendt
Involvement of perineuronal and perisynaptic extracellular matrix in Alzheimer's disease neuropathology
Brain Pathol. 2012 Jul;22(4):547-61.
(208)
Sang Won Cheung 1, Ekta Bhavnani 1, David G Simmons 1, Mark C Bellingham 1, Peter G Noakes 1 2
Perineuronal nets are phagocytosed by MMP-9 expressing microglia and astrocytes in the SOD1G93A ALS mouse model
Neuropathol Appl Neurobiol. 2024 Jun;50(3):e12982.
(209)
Sarah A Mauney 1, Katina M Athanas, Harry Pantazopoulos, Noel Shaskan, Eleonora Passeri, Sabina Berretta, Tsung-Ung W Woo
Developmental pattern of perineuronal nets in the human prefrontal cortex and their deficit in schizophrenia
Biol Psychiatry. 2013 Sep 15;74(6):427-35. 
(210)
H Pantazopoulos 1, M Markota 1, F Jaquet 2, D Ghosh 2, A Wallin 2, A Santos 2, B Caterson 3, S Berretta 4
Aggrecan and chondroitin-6-sulfate abnormalities in schizophrenia and bipolar disorder: a postmortem study on the amygdala
Transl Psychiatry. 2015 Jan 20;5(1):e496.
(211)
Kazuhiro Kon, Koji L. Ode, Tomoyuki Mano, Hiroshi Fujishima, Riina R. Takahashi, Daisuke Tone, Chika Shimizu, Shinnosuke Shiono, Saori Yada, Kyoko Matsuzawa, Shota Y. Yoshida, Junko Yoshida Garçon, Mari Kaneko, Yuta Shinohara, Rikuhiro G. Yamada, Shoi Shi, Kazunari Miyamichi, Kenta Sumiyama, Hiroshi Kiyonari, Etsuo A. Susaki & Hiroki R. Ueda 
Cortical parvalbumin neurons are responsible for homeostatic sleep rebound through CaMKII activation
Nature Communications volume 15, Article number: 6054 (2024) 
(212)
A Suttkus 1, S Rohn 1, S Weigel 1, P Glöckner 1, T Arendt 1, M Morawski 2
Aggrecan, link protein and tenascin-R are essential components of the perineuronal net to protect neurons against iron-induced oxidative stress
Cell Death Dis. 2014 Mar 13;5(3):e1119. 
(213)
Lu Zhang, Jing Zhou & Wei Kong
Extracellular matrix in vascular homeostasis and disease
Nature Reviews Cardiology (2025)
(214)
Javier Barallobre-Barreiro 1, Tamás Radovits 2, Marika Fava 1, Ursula Mayr 1, Wen-Yu Lin 1 3, Elizaveta Ermolaeva 1, Diego Martínez-López 4, Eric L Lindberg 5, Elisa Duregotti 1, László Daróczi 2, Maria Hasman 1, Lukas E Schmidt 1, Bhawana Singh 1, Ruifang Lu 1, Ferheen Baig 1, Aleksandra Malgorzata Siedlar 1, Friederike Cuello 6, Norman Catibog 1, Konstantinos Theofilatos 1, Ajay M Shah 1, Maria G Crespo-Leiro 7, Nieves Doménech 7, Norbert Hübner 5 8 9, Béla Merkely 2, Manuel Mayr 1
Extracellular Matrix in Heart Failure: Role of ADAMTS5 in Proteoglycan Remodeling
Circulation. 2021 Dec 21;144(25):2021-2034
(215)
Florian Schlotter 1, Arda Halu 1 2, Shinji Goto 1, Mark C Blaser 1, Simon C Body 3, Lang H Lee 1, Hideyuki Higashi 1, Daniel M DeLaughter 4, Joshua D Hutcheson 1 5, Payal Vyas 1, Tan Pham 1, Maximillian A Rogers 1, Amitabh Sharma 2, Christine E Seidman 4 6 7, Joseph Loscalzo 6, Jonathan G Seidman 4, Masanori Aikawa 1 2 8, Sasha A Singh 1, Elena Aikawa 1
Spatiotemporal Multi-Omics Mapping Generates a Molecular Atlas of the Aortic Valve and Reveals Networks Driving Disease
Circulation. 2018 Jul 24;138(4):377-393.
(216)
Athanasios Didangelos 1, Xiaoke Yin, Kaushik Mandal, Mark Baumert, Marjan Jahangiri, Manuel Mayr
Proteomics characterization of extracellular space components in the human aorta
Mol Cell Proteomics. 2010 Sep;9(9):2048-62.
(217)
Javier Barallobre-Barreiro 1, Rahmi Oklu 2, Marc Lynch 1, Marika Fava 3, Ferheen Baig 1, Xiaoke Yin 1, Temo Barwari 1, David N Potier 1, Hassan Albadawi 4, Marjan Jahangiri 5, Karen E Porter 6, Michael T Watkins 4, Sanjay Misra 7, Julianne Stoughton 4, Manuel Mayr 8
Extracellular matrix remodelling in response to venous hypertension: proteomics of human varicose veins
Cardiovasc Res. 2016 Jun 1;110(3):419-30. 
(218)
Peter A Henriksen 1, Jean-Michel Sallenave
Human neutrophil elastase: mediator and therapeutic target in atherosclerosis
Int J Biochem Cell Biol. 2008;40(6-7):1095-100.
(219)
Kalle Sipilä 1, Sabrina Haag 2, Konstantin Denessiouk 3, Jarmo Käpylä 1, Eric C Peters 4, Alexander Denesyuk 3, Uwe Hansen 5, Yrjö Konttinen 6, Mark S Johnson 3, Rikard Holmdahl 7, Jyrki Heino 8
Citrullination of collagen II affects integrin-mediated cell adhesion in a receptor-specific manner
FASEB J. 2014 Aug;28(8):3758-68. 
(220)
L M Sorokin 1, F Pausch, M Frieser, S Kröger, E Ohage, R Deutzmann
Developmental regulation of the laminin alpha5 chain suggests a role in epithelial and endothelial cell maturation
Dev Biol. 1997 Sep 15;189(2):285-300.
(221)
Thai Tran 1,2,3, Karol D McNeill 1,2,3, William T Gerthoffer 4, Helmut Unruh 5, Andrew J Halayko 1,
Endogenous laminin is required for human airway smooth muscle cell maturation
Respir Res. 2006 Sep 12;7(1):117.
(222)
Hung-Li Tsai 1, Wen-Ta Chiu, Chia-Lang Fang, Shiaw-Min Hwang, Perry F Renshaw, Wen-Fu Thomas Lai
Different forms of tenascin-C with tenascin-R regulate neural differentiation in bone marrow-derived human mesenchymal stem cells
Tissue Eng Part A. 2014 Jul;20(13-14):1908-21.
(223)
P Chrzanowski, S Keller, J Cerreta, I Mandl, G M Turino
Elastin content of normal and emphysematous lung parenchyma
Am J Med. 1980 Sep;69(3):351-9.
(224)
Robert P Mecham 1
Elastin in Lung Development and Disease Pathogenesis
Matrix Biol. 2018 Jan 11;73:6–20. 
(225)
R M Senior, D R Bielefeld, B C Starcher
Comparison of the elastolytic effects of human leukocyte elastase and porcine pancreatic elastase
Biochem Biophys Res Commun. 1976 Oct 18;72(4):1327-34.
(226)
Yongfeng Luo, Nan Li, Hui Chen, G. Esteban Fernandez, David Warburton, Rex Moats, Robert P. Mecham, Daria Krenitsky, Gloria S. Pryhuber & Wei Shi 
Spatial and temporal changes in extracellular elastin and laminin distribution during lung alveolar development
Scientific Reports volume 8, Article number: 8334 (2018) 
(227)
Sandrine Belouzard 1, Ikenna Madu 1, Gary R Whittaker 
Elastase-mediated Activation of the Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Spike Protein at Discrete Sites within the S2 Domain
J Biol Chem. 2010 May 27;285(30):22758–22763]
(228)
Federica Boraldi 1, Francesco Demetrio Lofaro 1, Andrea Cossarizza 2, Daniela Quaglino 1
The "Elastic Perspective" of SARS-CoV-2 Infection and the Role of Intrinsic and Extrinsic Factors
Int J Mol Sci. 2022 Jan 29;23(3):1559.
(229)
Suman Pokhrel 1, Benjamin R Kraemer 1, Lucia Lee 1, Kate Samardzic 1, Daria Mochly-Rosen 1
Increased elastase sensitivity and decreased intramolecular interactions in the more transmissible 501Y.V1 and 501Y.V2 SARS-CoV-2 variants' spike protein-an in silico analysis
PLoS One. 2021 May 26;16(5):e0251426.
(230)
M el-Ebiary 1, A Torres, J González, A Martos, J Puig de la Bellacasa, M Ferrer, R Rodriguez-Roisin
Use of elastin fibre detection in the diagnosis of ventilator associated pneumonia
Thorax. 1995 Jan;50(1):14-7.
(231)
D M Shlaes, M M Lederman, R Chmielewski, D Tweardy, G Krause, C Saffai
Sputum elastin fibers and the diagnosis of necrotizing pneumonia
Chest. 1984 Jun;85(6):763-6
(232)
D M Shlaes, M Lederman, R Chmielewski, D Tweardy, E Wolinsky
Elastin fibers in the sputum of patients with necrotizing pneumonia
Chest. 1983 Jun;83(6):885-9.
(233)
Aashrith Saraswathibhatla, Dhiraj Indana & Ovijit Chaudhuri
Cell–extracellular matrix mechanotransduction in 3D
Nature Reviews Molecular Cell Biology volume 24, pages495–516 (2023)
(234)
Ilya Levental 1, Penelope C Georges 1, Paul A Janmey
Soft biological materials and their impact on cell function
Soft Matter. 2007 Feb 14;3(3):299-306
(235)
Joe Swift 1, Irena L Ivanovska, Amnon Buxboim, Takamasa Harada, P C Dave P Dingal, Joel Pinter, J David Pajerowski, Kyle R Spinler, Jae-Won Shin, Manorama Tewari, Florian Rehfeldt, David W Speicher, Dennis E Discher
Nuclear lamin-A scales with tissue stiffness and enhances matrix-directed differentiation
Science. 2013 Aug 30;341(6149):1240104.
(236)
Ovijit Chaudhuri, Justin Cooper-White, Paul A. Janmey, David J. Mooney & Vivek B. Shenoy
Effects of extracellular matrix viscoelasticity on cellular behaviour
Nature volume 584, pages535–546 (2020)
(237)
Jenny Z Kechagia 1, Johanna Ivaska 2 3, Pere Roca-Cusachs 4
Integrins as biomechanical sensors of the microenvironment
Nat Rev Mol Cell Biol. 2019 Aug;20(8):457-473.
(238)
Richard F Keep 1,2,*, Ya Hua 1, Guohua Xi 1
Brain water content. A misunderstood measurement?
Transl Stroke Res. 2012 Jun 1;3(2):263–265
(239)
Leonard G. Rowntree
THE WATER BALANCE OF THE BODY
Physiological Reviews vol.2 p.116-169 (1922)
(240)
Sharon Gerecht 1, Jason A Burdick, Lino S Ferreira, Seth A Townsend, Robert Langer, Gordana Vunjak-Novakovic
Hyaluronic acid hydrogel for controlled self-renewal and differentiation of human embryonic stem cells
Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Jul 3;104(27):11298-303
(241)
Alfonso Gautieri 1, Simone Vesentini, Alberto Redaelli, Markus J Buehler
Hierarchical structure and nanomechanics of collagen microfibrils from the atomistic scale up
Nano Lett. 2011 Feb 9;11(2):757-66. 
(242)
Cornelis Storm 1, Jennifer J Pastore, F C MacKintosh, T C Lubensky, Paul A Janmey
Nonlinear elasticity in biological gels
Nature. 2005 May 12;435(7039):191-4.
(243)
Peter D Yurchenco 1
Basement membranes: cell scaffoldings and signaling platforms
Cold Spring Harb Perspect Biol. 2011 Feb 1;3(2):a004911.
(244)
Dario Di Stasio 1,†, Dorina Lauritano 2,*,†, Hasan Iquebal 3, Antonio Romano 1, Enrica Gentile 1, Alberta Lucchese 1
Measurement of Oral Epithelial Thickness by Optical Coherence Tomography
Diagnostics (Basel). 2019 Aug 6;9(3):90
(245)
Kenneth M. Yamada & Michael Sixt
Mechanisms of 3D cell migration
Nature Reviews Molecular Cell Biology volume 20, pages738–752 (2019)
(246)
Adam Engler 1, Lucie Bacakova, Cynthia Newman, Alina Hategan, Maureen Griffin, Dennis Discher
Substrate compliance versus ligand density in cell on gel responses
Biophys J. 2004 Jan;86(1 Pt 1):617-28.
(247)
Raimon Sunyer 1, Vito Conte 1, Jorge Escribano 2, Alberto Elosegui-Artola 1, Anna Labernadie 1, Léo Valon 1, Daniel Navajas 3, José Manuel García-Aznar 2, José J Muñoz 4, Pere Roca-Cusachs 5, Xavier Trepat 6
Collective cell durotaxis emerges from long-range intercellular force transmission
Science. 2016 Sep 9;353(6304):1157-61.
(248)
William J Polacheck 1, Alexandra E German, Akiko Mammoto, Donald E Ingber, Roger D Kamm
Mechanotransduction of fluid stresses governs 3D cell migration
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Feb 18;111(7):2447-52. 
(249)
Adam J Engler 1, Shamik Sen, H Lee Sweeney, Dennis E Discher
Matrix elasticity directs stem cell lineage specification
Cell. 2006 Aug 25;126(4):677-89.
(250)
Eric A Klein 1, Liqun Yin, Devashish Kothapalli, Paola Castagnino, Fitzroy J Byfield, Tina Xu, Ilya Levental, Elizabeth Hawthorne, Paul A Janmey, Richard K Assoian
Cell-cycle control by physiological matrix elasticity and in vivo tissue stiffening
Curr Biol. 2009 Sep 29;19(18):1511-8
(251)
Oksana Y. Dudaryeva, Aurelia Bucciarelli, Giovanni Bovone, Florian Huwyler, Shibashish Jaydev, Nicolas Broguiere, Marwa al-Bayati, Marco Lütolf, Mark W. Tibbitt
3D Confinement Regulates Cell Life and Death
Advanced Functional Materials vol.31 2104098 (2021)
(252)
C S Chen 1, M Mrksich, S Huang, G M Whitesides, D E Ingber
Geometric control of cell life and death
Science. 1997 May 30;276(5317):1425-8
(253)
Michael J. Kratochvil, Alexis J. Seymour, Thomas L. Li, Sergiu P. Paşca, Calvin J. Kuo & Sarah C. Heilshorn
Engineered materials for organoid systems
Nature Reviews Materials volume 4, pages606–622 (2019)
(254)
S Rezakhani 1, N Gjorevski 2, M P Lutolf 3
Extracellular matrix requirements for gastrointestinal organoid cultures
Biomaterials. 2021 Sep:276:121020. 
(255)
Dhiraj Indana 1, Pranay Agarwal 2, Nidhi Bhutani 2, Ovijit Chaudhuri 
Viscoelasticity and Adhesion Signaling in Biomaterials Control Human Pluripotent Stem Cell Morphogenesis in 3D Culture
Adv Mater. 2021 Oct;33(43):e2101966.
(256)
Michael R Blatchley 1 2, Franklyn Hall 1 2, Songnan Wang 2, Hawley C Pruitt 2, Sharon Gerecht 1 2 3
Hypoxia and matrix viscoelasticity sequentially regulate endothelial progenitor cluster-based vasculogenesis
Sci Adv. 2019 Mar 20;5(3):eaau7518. 
(257)
N Gjorevski # 1, M Nikolaev # 1, T E Brown # 2 3, O Mitrofanova 1, N Brandenberg 1, F W DelRio 4, F M Yavitt 2 3, P Liberali 5, K S Anseth 2 3, M P Lutolf 1 6
Tissue geometry drives deterministic organoid patterning
Science. 2022 Jan 7;375(6576):eaaw9021. 
(258)
Antonius Chrisnandy # 1, Delphine Blondel # 1, Saba Rezakhani 1, Nicolas Broguiere 1, Matthias P Lutolf 2 3
Synthetic dynamic hydrogels promote degradation-independent in vitro organogenesis
Nat Mater. 2022 Apr;21(4):479-487
(259)
Daniel A Fletcher 1, R Dyche Mullins
Cell mechanics and the cytoskeleton
Nature. 2010 Jan 28;463(7280):485-92. 
(260)
Florian Gaertner 1, Patricia Reis-Rodrigues 2, Ingrid de Vries 2, Miroslav Hons 3, Juan Aguilera 2, Michael Riedl 2, Alexander Leithner 2, Saren Tasciyan 2, Aglaja Kopf 2, Jack Merrin 2, Vanessa Zheden 2, Walter Anton Kaufmann 2, Robert Hauschild 2, Michael Sixt 4
WASp triggers mechanosensitive actin patches to facilitate immune cell migration in dense tissues
Dev Cell. 2022 Jan 10;57(1):47-62.e9
(261)
Preethi L Chandran 1, Victor H Barocas
Microstructural mechanics of collagen gels in confined compression: poroelasticity, viscoelasticity, and collapse
J Biomech Eng. 2004 Apr;126(2):152-66
(262)
Matthew S Hall 1, Farid Alisafaei 2, Ehsan Ban 2, Xinzeng Feng 3, Chung-Yuen Hui 3, Vivek B Shenoy 4, Mingming Wu 5
Fibrous nonlinear elasticity enables positive mechanical feedback between cells and ECMs
Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Dec 6;113(49):14043-14048.
(263)
I Acerbi 1, L Cassereau, I Dean, Q Shi, A Au, C Park, Y Y Chen, J Liphardt, E S Hwang, V M Weaver
Human breast cancer invasion and aggression correlates with ECM stiffening and immune cell infiltration
Integr Biol (Camb). 2015 Oct;7(10):1120-34.
(264)
Zizhao Mai, Yunfan Lin, Pei Lin, Xinyuan Zhao & Li Cui 
Modulating extracellular matrix stiffness: a strategic approach to boost cancer immunotherapy
Cell Death & Disease volume 15, Article number: 307 (2024) 
(265)
Matthew J Paszek 1, Nastaran Zahir, Kandice R Johnson, Johnathon N Lakins, Gabriela I Rozenberg, Amit Gefen, Cynthia A Reinhart-King, Susan S Margulies, Micah Dembo, David Boettiger, Daniel A Hammer, Valerie M Weaver
Tensional homeostasis and the malignant phenotype
Cancer Cell. 2005 Sep;8(3):241-54. 
(266)
Paolo P Provenzano 1, David R Inman, Kevin W Eliceiri, Justin G Knittel, Long Yan, Curtis T Rueden, John G White, Patricia J Keely
Collagen density promotes mammary tumor initiation and progression
BMC Med. 2008 Apr 28:6:11. 
(267)
James H-C Wang 1
Mechanobiology of tendon
J Biomech. 2006;39(9):1563-82
(268)
Ehsan Ban 1, J Matthew Franklin 2, Sungmin Nam 3, Lucas R Smith 4, Hailong Wang 1, Rebecca G Wells 5, Ovijit Chaudhuri 3, Jan T Liphardt 2, Vivek B Shenoy 6
Mechanisms of Plastic Deformation in Collagen Networks Induced by Cellular Forces
Biophys J. 2018 Jan 23;114(2):450-461.
(269)
R E Shadwick 
Mechanical design in arteries
J Exp Biol. 1999 Dec;202(Pt 23):3305-13. 
(270)
Xiaobo Wang a b, Hanxing Zhu a, Bo Song b, Xindong Chen a c, David Kennedy a, Yusheng Shi
Nonlinear elastic behaviors and deformation mechanisms of nano-structured crosslinked biopolymer networks
Extreme Mechanics Letters Volume 61, June 2023, 102017
(271)
Sungmin Nam 1, Kenneth H Hu 2, Manish J Butte 3, Ovijit Chaudhuri 
Strain-enhanced stress relaxation impacts nonlinear elasticity in collagen gels
Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 May 17;113(20):5492-7.
(272)
Frederick H Silver 1, Joseph W Freeman, Gurinder P Seehra
Collagen self-assembly and the development of tendon mechanical properties
J Biomech. 2003 Oct;36(10):1529-53
(273)
Weiguo Fan, Kolade Adebowale, Lóránd Váncza, Yuan Li, Md Foysal Rabbi, Koshi Kunimoto, Dongning Chen, Gergely Mozes, David Kung-Chun Chiu, Yisi Li, Junyan Tao, Yi Wei, Nia Adeniji, Ryan L. Brunsing, Renumathy Dhanasekaran, Aatur Singhi, David Geller, Su Hao Lo, Louis Hodgson, Edgar G. Engleman, Gregory W. Charville, Vivek Charu, Satdarshan P. Monga, Taeyoon Kim, Rebecca G. Wells, Ovijit Chaudhuri & Natalie J. Török
Matrix viscoelasticity promotes liver cancer progression in the pre-cirrhotic liver
Nature volume 626, pages635–642 (2024)
(274)
Ovijit Chaudhuri 1 2 3, Luo Gu 1 2, Darinka Klumpers 1 2 4, Max Darnell 1 2, Sidi A Bencherif 1 2, James C Weaver 2, Nathaniel Huebsch 1 5, Hong-Pyo Lee 3, Evi Lippens 2 6, Georg N Duda 6, David J Mooney 
Hydrogels with tunable stress relaxation regulate stem cell fate and activity
Nat Mater. 2016 Mar;15(3):326-34.
(275)
Christopher M Madl 1, Bauer L LeSavage 1, Ruby E Dewi 2, Cong B Dinh 2, Ryan S Stowers 3, Margarita Khariton 1, Kyle J Lampe 2 4, Duong Nguyen 5, Ovijit Chaudhuri 3, Annika Enejder 2 5, Sarah C Heilshorn 2
Maintenance of neural progenitor cell stemness in 3D hydrogels requires matrix remodelling
Nat Mater. 2017 Dec;16(12):1233-1242.

0 コメント:

コメントを投稿

 
;